R语言 daMA包 core()函数中文帮助文档(中英文对照)

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core(daMA)
core()所属R语言包：daMA

                                        Internal function of analyseMA
                                         内部的analyseMA功能

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This internal function of analyseMA computes the statistics and estimators that are organised and given out by the main function analyseMA.
内部功能这对analyseMA的计算，统计和组织给予主要功能analyseMA的估计。


用法----------Usage----------


core(vector, design, cmat, cinfo, tol)



参数----------Arguments----------

参数：vector
a simple help variable for the apply call
一个简单的apply帮助变量调用


参数：design
the design matrix of size N \times (K+2), where K is the number of experimental conditions. This is the design matrix X known from linear model theory and its elements are typically 0, 1, or -1. A 0 means that the associated parameter does not apply for the corresponding observation (i.e., row). The first two columns are reserved for the two dyes and are usually filled up with 1 and -1, respectively.  
N \times (K+2)设计矩阵的大小，其中K是实验条件。这是通常称为线性模型的理论和它的元素的X是设计矩阵0，1或-1。 0值表示相关参数并不适用于相应的观察（即行）。保留两种染料的前两列，分别为1和-1，通常是充满了。


参数：cmat
a matrix describing the p experimental questions (contrasts) to be analysed in the experiment. The matrix can be composed of vectorial contrasts (a single row of the matrix) and of contrasts in matrix form (several rows of the matrix), e.g. an A \times B interaction effect in a 3 \times 2 design. All contrasts have to be combined into one matrix (using rbind for instance).  
在实验中进行分析的矩阵描述的P实验问题（对比）。矩阵可组成矢量对比（单列的矩阵）和对比矩阵形式（矩阵的几行），例如A \times B3 \times 2设计中的互动效应。所有对比都必须结合成一个矩阵（例如使用rbind）。


参数：cinfo
a vector of length p describing the grouping of the contrast matrix rows in vector or matrix  form. E.g. if the design matrix contains three contrasts in vector form, cinfo = rep(1,3), if it contains two vectorial contratst and one as matrix with three rows, cinfo=c(1,1,3).  
对比矩阵的行向量或矩阵形式描述了分组的长度P级的向量。例如如果设计矩阵包含三个对比向量形式，CINFO =（1,3）代表，如果它包含两个的矢量contratst和三行为基质，CINFO = C（1,1,3）。


参数：tol
A value indicating the tolerance for contrast estimability check  
一个值，该值指示的对比估计性检查的耐受性


作者（S）----------Author(s)----------


Jobst Landgrebe (jlandgr1@gwdg.de) and Frank Bretz (bretz@bioinf.uni-hannover.de)



参考文献----------References----------

two colour factorial microarray experiments", submitted. http://www.microarrays.med.uni-goettingen.de/
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注：
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