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R语言 cummeRbund包 getGenes()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 16:11:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
getGenes(cummeRbund)
getGenes()所属R语言包:cummeRbund

                                         getGenes
                                         getGenes

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Primary accessor from a CuffSet object to retrive all related information for >1 (MANY) given genes, indexed by gene_id or gene_short_name.
从CuffSet对象> 1(许多)给予基因由gene_id或gene_short_name的索引,以检索所有相关信息的存取。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'CuffSet'
getGenes(object, geneIdList, sampleIdList=NULL)



参数----------Arguments----------

参数:object
An object of class 'CuffSet' (Primary 'pointer' object for Cufflinks data).  
一个类的CuffSet对象(小学的“指针”为袖扣数据对象)。


参数:geneIdList
A vector of gene_ids or gene_short_namesto identify which genes for which you would like to retrieve all information.  
一个向量的gene_ids或gene_short_namesto的找出哪些基因为你想获取所有信息。


参数:sampleIdList
A vector of sample names used to subset or re-order samples in returned object  
在返回的对象子集或重新排列样品的样品名称向量


Details

详情----------Details----------

None.
没有。


值----------Value----------

Returns a CuffGeneSet object containing all related information for a given set of gene_id or gene_short_name values
返回一个包含所有相关信息的gene_id或gene_short_name值给定的CuffGeneSet对象


注意----------Note----------

Right now, this does not return an error if it cannot find a gene.  (this is probably a bad thing...)
眼下,这并不返回一个错误,如果它不能找到一个基因。 (这可能是一件坏事......)


作者(S)----------Author(s)----------



Loyal A. Goff




参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


        a<-readCufflinks(system.file("extdata", package="cummeRbund")) #Read cufflinks data and create master CuffSet object[阅读袖扣数据和创建主CuffSet对象]
        data(sampleData)
        sampleIDs
        myGene<-getGenes(a,sampleIDs) # Retrieve all information for a set of 20 'sample' genes.[检索所有的一套20样本的基因信息。]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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