xcluster2r(ctc)
xcluster2r()所属R语言包：ctc
Importing Xcluster/Cluster output
进口Xcluster /输出聚类
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Converting Xcluster/Cluster output (.gtr or .atr) to R hclust file
的转换Xcluster /聚类输出（GTR或。ATR）到R hclust文件
用法----------Usage----------
xcluster2r(file,distance="euclidean",labels=FALSE,fast=FALSE,clean=FALSE,
dec='.')
参数----------Arguments----------
参数：file
the path of a Xcluster/Cluster file (.gtr or .atr)
一个Xcluster /聚类文件的路径（。GTR。ATR）
参数：distance
The distance measure used with Xcluster/Cluster. This must be one of "euclidean", "pearson" or "notcenteredpearson". Any unambiguous substring can be given.
与Xcluster /聚类使用的距离度量。这必须是一个"euclidean"，"pearson"或"notcenteredpearson"。可以给出任何明确的子串。
参数：labels
a logical value indicating whether we use labels values (in the .cdt file) or not.
一个逻辑值，指示是否使用标签值。CDT文件或不。
参数：fast
a logical value indicating whether we reorganize data like R (Fast=FALSE) or we let them like Xcluster/Cluster did
一个逻辑值，表明我们是否重组数据如R（Fast=FALSE），或让他们像Xcluster /聚类做
参数：clean
a logical value indicating whether you want the true distances (clean=FALSE), or you want a clean dendrogram (see details below).
一个逻辑值，指明是否你想真正的距离（clean=FALSE），或者你想要一个干净的树状图（详见下文）。
参数：dec
the character used in the file for decimal points
在文件中使用的字符，小数点
Details
详情----------Details----------
See xcluster for more details.
详情请参阅xcluster。
值----------Value----------
An object of class hclust which describes the tree produced by the clustering process.
一个对象的的类hclust介绍聚类过程中所产生的树。
注意----------Note----------
Xcluster is a C program made by Gavin Sherlock that performs hierarchical clustering, K-means and SOM.
xcluster是一个C程序由Gavin福尔摩斯进行分层聚类，K-手段和SOM。
Xcluster is copyrighted. To get or have information about Xcluster: http://genome-www.stanford.edu/~sherlock/cluster.html
xcluster的版权。为了获得或拥有的信息关于Xcluster：http://genome-www.stanford.edu/~福尔摩斯/ cluster.html的
Cluster is a program made by Michael Eisen that performs hierarchical clustering, K-means and SOM.
聚类是由迈克尔·艾森提出了方案，进行分层聚类，K-手段和SOM。
Cluster is copyrighted. To get or have information about Cluster: http://rana.lbl.gov/EisenSoftware.htm
版权聚类。若要取得或有关聚类的信息：http://rana.lbl.gov/EisenSoftware.htm
作者（S）----------Author(s)----------
Antoine Lucas, <a href="http://mulcyber.toulouse.inra.fr/projects/amap/">http://mulcyber.toulouse.inra.fr/projects/amap/</a>
参考文献----------References----------
for Huge Clustering, R News, 2006, vol 6, issue 5 pages 58-60.
参见----------See Also----------
xcluster, r2xcluster, hclust, hcluster
xcluster，r2xcluster，hclust，hcluster
举例----------Examples----------
# Create data[创建数据]
set.seed(1)
m <- matrix(rep(1,3*24),ncol=3)
m[9:16,3] <- 3 ; m[17:24,] <- 3 #create 3 groups[创建3组]
m <- m+rnorm(24*3,0,0.5) #add noise[添加噪声]
m <- floor(10*m)/10 #just one digits[只是一个数字]
r2xcluster(m)
# And once you have Xcluster program:[一旦你有Xcluster方案：]
#[]
#system('Xcluster -f xcluster.txt -e 0 -p 0 -s 0 -l 0')[系统（“Xcluster-F xcluster.txt-E-P 0-0-L 0）]
#h <- xcluster2r('xcluster.gtr')[H < - xcluster2r（“xcluster.gtr）]
#plot(h,hang=-1)[积（H，挂起= -1）]
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-2-25 16:07:51
