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R语言 coRNAi包 PlotHeatmap()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 15:52:11 | 显示全部楼层 |阅读模式
PlotHeatmap(coRNAi)
PlotHeatmap()所属R语言包:coRNAi

                                         Plot a heatmap of interactions
                                         绘制一个相互作用的热图

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots a heatmap of the mean residuals for each interaction pair.
绘制平均每个交互对残差的热图。


用法----------Usage----------


PlotHeatmap(toptable, colpal = colorRampPalette(c("blue", "white", "yellow")),
key=FALSE,margins=c(7,7),na.color="grey",breaks=seq(-1,1,by=0.01),...)



参数----------Arguments----------

参数:toptable
a data frame created by with the interaction estimates as "logFC" and pair id as "ID". Usually created by topTable function in limma  
互动创建一个数据框估计的“logFC”和“身份证”对id。通常在limma topTable功能创建


参数:colpal
color palette to be used in the plot  
在小区使用调色板


参数:key
logical should a color key be included  
逻辑应该颜色键


参数:margins
margins for plot  
利润率为图


参数:na.color
color for NA values  
颜色为无值


参数:breaks
mapping data to colors in colpal  
映射数据colpal颜色的


参数:...
additional arguments to be passed to heatmap.2 call  
额外的参数被传递到heatmap.2呼叫


值----------Value----------

a plot



作者(S)----------Author(s)----------



Elin Axelsson




参见----------See Also----------

heatmap.2
heatmap.2


举例----------Examples----------


# similated data[similated数据]
data(screen1_raw)
df = cellHTS2df(screen1_raw,neutral="Fluc")
tt = data.frame("ID"=(unique(df$Pair[df$Type=="comb"])),"size"=runif(length(unique(df$Pair[df$Type=="comb"])),-2,2),stringsAsFactors=FALSE)
PlotHeatmap(tt)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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