PlotHeatmap(coRNAi)
PlotHeatmap()所属R语言包:coRNAi
Plot a heatmap of interactions
绘制一个相互作用的热图
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plots a heatmap of the mean residuals for each interaction pair.
绘制平均每个交互对残差的热图。
用法----------Usage----------
PlotHeatmap(toptable, colpal = colorRampPalette(c("blue", "white", "yellow")),
key=FALSE,margins=c(7,7),na.color="grey",breaks=seq(-1,1,by=0.01),...)
参数----------Arguments----------
参数:toptable
a data frame created by with the interaction estimates as "logFC" and pair id as "ID". Usually created by topTable function in limma
互动创建一个数据框估计的“logFC”和“身份证”对id。通常在limma topTable功能创建
参数:colpal
color palette to be used in the plot
在小区使用调色板
参数:key
logical should a color key be included
逻辑应该颜色键
参数:margins
margins for plot
利润率为图
参数:na.color
color for NA values
颜色为无值
参数:breaks
mapping data to colors in colpal
映射数据colpal颜色的
参数:...
additional arguments to be passed to heatmap.2 call
额外的参数被传递到heatmap.2呼叫
值----------Value----------
a plot
图
作者(S)----------Author(s)----------
Elin Axelsson
参见----------See Also----------
heatmap.2
heatmap.2
举例----------Examples----------
# similated data[similated数据]
data(screen1_raw)
df = cellHTS2df(screen1_raw,neutral="Fluc")
tt = data.frame("ID"=(unique(df$Pair[df$Type=="comb"])),"size"=runif(length(unique(df$Pair[df$Type=="comb"])),-2,2),stringsAsFactors=FALSE)
PlotHeatmap(tt)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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