cormotiffitsep(Cormotif)
cormotiffitsep()所属R语言包：Cormotif
Individual Study Motif Fit
个别研究母题飞度
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function fits a mixture modified t-distribution model to each study seperately.
此功能适合混合物改性t分布模型，每一个研究分开。
用法----------Usage----------
cormotiffitsep(exprs,groupid,compid, tol=1e-3, max.iter=100)
参数----------Arguments----------
参数：exprs
a matrix, the expression data after normalization that is on log2 scale, each row of the matrix corresponds to a gene and each column of the matrix corresponds to a sample array.
一个矩阵，后标准化是log2对数值，矩阵的每一行对应的基因和矩阵的每一列对应一个样品阵列基因表达数据。
参数：groupid
the group label for each sample array, two arrays in the same study with same experinment condition(e.g. control) have the same groupid.
每个样品阵列组的标签，两个在同一研究的相同experinment条件(e.g. control)有相同的GroupId数组。
参数：compid
the study design and comparison matrix, each row of the matrix corresponds to one study with the first column being the first experinment condition and the second column being the second experinment condition
研究设计和比较矩阵，矩阵的每一行对应一个研究是第一experinment条件的第一列和第二列被第二experinment条件
参数：tol
the relative tolerance level of error.
相对误差容忍程度。
参数：max.iter
maximun number of iterations.
最长数量的迭代。
值----------Value----------
参数：p.post
the posterior probability for each gene to be differentially expressed.
后验概率为每一个基因的差异表达。
参数：motif.prior
fitted values of the probability for genes to be differentially expressed in each study, a 1*D vector, where D is the number of studies
在每个研究差异表达基因的概率拟合值，1*D向量，其中D数的研究
参数：loglike
log-likelihood of the fitted model.
log拟合模型的可能性。
作者（S）----------Author(s)----------
Hongkai Ji, Yingying Wei
参考文献----------References----------
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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发表于 2012-2-25 15:49:46
