R语言 Cormotif包 cormotiffitfull()函数中文帮助文档(中英文对照)

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cormotiffitfull(Cormotif)
cormotiffitfull()所属R语言包：Cormotif

                                        Full Model Motif Fit
                                         全部型号的母题飞度

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function fits the data to the model with all 2^D possible 0-1 patterns, where D is the number of studies.
此功能适合所有2^D可能0-1模式的数据模型，其中D是多项研究。


用法----------Usage----------


cormotiffitfull(exprs,groupid,compid, tol=1e-3, max.iter=100)



参数----------Arguments----------

参数：exprs
a matrix, the expression data after normalization that is on log2 scale, each row of the matrix corresponds to a gene and each column of the matrix corresponds to a sample array.  
一个矩阵，后标准化是log2对数值，矩阵的每一行对应的基因和矩阵的每一列对应一个样品阵列基因表达数据。


参数：groupid
the group label for each sample array, two arrays in the same study with same experinment condition(e.g. control) have the same groupid.  
每个样品阵列组的标签，两个在同一研究的相同experinment条件(e.g. control)有相同的GroupId数组。


参数：compid
the study design and comparison matrix, each row of the matrix corresponds to one study with the first column being the first experinment condition and the second column being the second experinment condition
研究设计和比较矩阵，矩阵的每一行对应一个研究是第一experinment条件的第一列和第二列被第二experinment条件


参数：tol
the relative tolerance level of error.  
相对误差容忍程度。


参数：max.iter
maximun number of iterations.  
最长数量的迭代。


Details

详情----------Details----------

The difference between cormotiffitfull and cormotif(...,K=2^D,...) is that cormotiffitfull forces motif to be one of the those 0-1 patterns. For cormotiffit, the motif does not necessarily to be of either 1 or 0, such as (0,1,..,0). It could be (0.9,0.4,...,0.2).  
cormotiffitfull和cormotif(...,K=2^D,...)是cormotiffitfull势力主题是那些0-1模式之间的差异。 ：cormotiffit，Motif的并不一定是0或1，如（0,1，...，0）。这可能是（0.9,0.4，...，0.2）。


值----------Value----------


参数：p.post
the posterior probability for each gene to be differentially expressed.  
后验概率为每一个基因的差异表达。


参数：motif.prior
fitted values of the probability distribution of the 2^D 0-1 motifs.
2^D0-1图案的概率分布拟合值。


参数：loglike
log-likelihood of the fitted model.  
log拟合模型的可能性。


作者（S）----------Author(s)----------


Hongkai Ji, Yingying Wei



参考文献----------References----------

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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