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R语言 codelink包 normalize.loess()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 15:46:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
normalize.loess(codelink)
normalize.loess()所属R语言包:codelink

                                        Normalized chips using cyclic loess.
                                         使用循环黄土归芯片。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Takes a matrix and apply cyclic loess normalization. It is based in normalize.loess from package affy but supports NA.
注意到矩阵和申请循环黄土标准化。它是基于在从包affy normalize.loess但支持不适用。


用法----------Usage----------


  normalize.loess(mat, subset = sample(1dim(mat)[1]),
    min(c(5000,        nrow(mat)))), epsilon = 10^-2, maxit = 1, log.it = TRUE,
        verbose = FALSE, span = 2/3, family.loess = "symmetric", weights = NULL)



参数----------Arguments----------

参数:mat
a matrix with columns containing the values of the chips to normalize.
用含有芯片的值标准化列的矩阵。


参数:subset
a subset of the data to fit a loess to.
适合黄土到的数据的一个子集。


参数:epsilon
a tolerance value (supposed to be a small value - used as a stopping criterium).
公差值(应该是一个很小的值 - 作为停止绕圈)。


参数:maxit
maximum number of iterations.
最大迭代次数。


参数:log.it
logical. If TRUE it takes the log2 of mat
逻辑。如果TRUEmat的的log2


参数:verbose
logical. If TRUE displays current pair of chip being worked on.
逻辑。 TRUE如果显示芯片的电流对工作。


参数:span
parameter to be passed the function loess
参数被传递函数loess


参数:family.loess
parameter to be passed the function loess. "gaussian" or "symmetric" are acceptable values for this parameter.
参数被传递函数loess。 "gaussian"或"symmetric"此参数可接受的值。


参数:weights
a vector of weights for the individual measurements.
个别测量的权重向量。


值----------Value----------

A matrix of normalized values.
标准化值矩阵。


作者(S)----------Author(s)----------


Diego Diez



举例----------Examples----------


## Not run: [#无法运行:]
        mat <- matrix(sample(500), 100, 5)
        mat <- normalize.loess(mat)

## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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