R语言 CNAnorm包 plotPeaks()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotPeaks(CNAnorm)
plotPeaks()所属R语言包：CNAnorm

                                         Methods for Function plotPeaks in Package ‘CNAnorm’
                                         功能plotPeaks方法包CNAnorm

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

plotPeaks plot annotated distribution of ratio Test/Normal
plotPeaks积比率注明的分布测试/正常


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'CNAnorm'
plotPeaks(object, special1 = character(0), special2 = character(0),
    show ='suggested', adjust = get.adjust(object), n = get.n(object), ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
An object of Class "CNAnorm"
一个对象的类"CNAnorm"


参数：special1
The chromosome/contig whose distribution will be shown with a different color  
染色体/重叠群的分布将用不同的颜色显示


参数：special2
The chromosome/contig whose distribution will be shown with a different color  
染色体/重叠群的分布将用不同的颜色显示


参数：show
A character verctor with one or both of the following: "suggested", "validated". Specify what need to be plotted  
"suggested"，"validated"：与一个或两个下列字符verctor。指定需要被绘制


参数：adjust
The adjust parameter for function "density". Default will  retrieve the values use for peakPloidy
调整参数的功能"density"。默认将检索值peakPloidy使用


参数：n
The n parameter for function "density". Default will  retrieve the values use for peakPloidy
功能"density"n参数。默认将检索值peakPloidy使用


参数：...
Further arguments to pass to the function plot
进一步的参数传递给函数plot


作者（S）----------Author(s)----------


Stefano Berri <a href="mailto:s.berri@leeds.ac.uk">s.berri@leeds.ac.uk</a>



参见----------See Also----------

plot, validation, peakPloidy
plot，validation，peakPloidy


举例----------Examples----------


data(CN)
# see peakPloidy documentation to know how object CN is created[看到peakPloidy文档，以了解如何创建对象CN]
plotPeaks(CN, special1 = 'chrX', special2 = 'chrY')

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注：
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