R语言 CNAnorm包 gcNorm()函数中文帮助文档(中英文对照)

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gcNorm(CNAnorm)
gcNorm()所属R语言包：CNAnorm

                                         Methods for Function gcNorm in Package ‘CNAnorm’
                                         功能gcNorm方法包CNAnorm

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

gcNorm perform GC content normalization on ratio Test/Normal in Package "CNAnorm"
gcNorm执行测试/正常包CNAnorm上比GC含量标准化


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'CNAnorm'
gcNorm(object, exclude = character(0), maxNumPoints = 10000)



参数----------Arguments----------

参数：object
An object of Class "CNAnorm"
一个对象的类"CNAnorm"


参数：exclude
A character vector with name of chromosomes/contigues  not to use to calculate GC content correction. All genome, however, will be corrected
一个特征向量与染色体/ contigues的名称不使用计算GC含量校正。然而，所有的基因组，将予以纠正


参数：maxNumPoints
Maximum number of data points to fit the loess correction. For computational pourposes, if the number of points in ratio(object) is greater than maxNumPoints, only maxNumPoints randomly selected  will be used  
最大数量的数据点，以适应黄土校正。对于计算pourposes，如果点ratio(object)的数量是比maxNumPoints，只有maxNumPoints随机选取将使用


值----------Value----------

An object of class "CNAnorm"
一个对象的类"CNAnorm"


方法----------Methods----------




signature(object = "CNAnorm")  Perform GC content correction on
signature(object = "CNAnorm")执行GC含量校正


作者（S）----------Author(s)----------


Stefano Berri <s.berri@leeds.ac.uk>



参见----------See Also----------

loess, CNAnorm-class, ratio
loess，CNAnorm-class，ratio


举例----------Examples----------


data(LS041)
CN <- dataFrame2object(LS041)
# correct for GC content, but ignoring data from sex chromosomes and[纠正GC含量，但忽视性染色体的数据和]
# mitocondria[mitocondria]
CN.gcNorm <- gcNorm(CN, exclude = c("chrX", "chrY", "chrM"))


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