R语言 CNAnorm包 DerivData-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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DerivData-class(CNAnorm)
DerivData-class()所属R语言包：CNAnorm

                                        Class "DerivData"
                                         类“DerivData”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A Class containing data derived from InData used for further computation and plotting.
A类含有从InData的数据用于进一步的计算和绘图。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("DerivData"), however DerivData is typically  populated using methods. If a slot has not been populated yet, it has zero length, otherwise slots have the same length as InData.
可以创建对象调用的形式new("DerivData")，但是DerivData通常使用的方法填充。如果一个槽尚未填充，它的长度为零，否则插槽有InData的长度相同。


插槽----------Slots----------




ratio: Numeric vector with ratio Test/Normal. Optionally GC corrected.
ratio：比数字矢量测试/正常。可选的GC纠正。




ratio.s: Numeric vector with smoothed ratio.
ratio.s：平滑的比例数字向量。




ratio.n: Numeric vector with normalized ratio.
ratio.n：标准化比值的数字向量。




ratio.s.n: Numeric vector with normalized and smoothed ratio.
ratio.s.n：规范化和平滑的比例数字向量。




segID: Numeric vecotr with ID of segmented data (as provided by DNACopy).
segID：分段数据的ID的数字vecotr（如由DNACopy提供）。




segMean: Numeric vector with mean value of the segment (as provided by DNACopy.)
segMean：（。作为提供DNACopy）段的平均值的数字矢量




segMean.n: Numeric vector with normalized segMean.
segMean.n：向量与归segMean数字。




ok4density: Logical vector. Specify wich values have been used to calculate density.
ok4density：逻辑向量。指定wich值已被用来计算密度。


方法----------Methods----------




length signature(x = "DerivData"): Returns number of windows.
长度signature(x = "DerivData")：返回窗口的个数。


作者（S）----------Author(s)----------


Stefano Berri and Arief Gusnanto



参考文献----------References----------

(2011) Correcting for cancer genome size and tumor cell content enables better estimation of copy number alterations from next generation sequence

参见----------See Also----------

CNAnorm, InData-class
CNAnorm，InData-class


举例----------Examples----------


data(LS041)
inObject <- new("InData", Chr = as.character(LS041$Chr),
    Pos = LS041$Pos, Test = LS041$Test, Norm = LS041$Norm,
    GC = LS041$GC)
CNA <- new("CNAnorm", InData = inObject)

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