R语言 cn.farms包 normalizeNpData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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normalizeNpData(cn.farms)
normalizeNpData()所属R语言包：cn.farms

                                        Processes the non-polymorphic data
                                         处理非多态性数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Normalization for non-polymorphic data for Affymetrix SNP5 and SNP6
标准化的Affymetrix公司SNP5和SNP6非多态性数据


用法----------Usage----------


  normalizeNpData(filenames, cores = 1, annotDir = NULL,
    runtype = "ff", saveFile = "npData",
    method = c("baseline", "quantiles", "none"))



参数----------Arguments----------

参数：filenames
the absolute path of the CEL files as a list
列表CEL文件的绝对路径


参数：cores
number of cores for used for parallelization
为核心的数量为并行使用


参数：annotDir
Optional annotation directory.
可选的注释目录。


参数：runtype
Mode how the results are saved. Possible values are ff or bm. If ff is chosen the data will not be saved automatically. With bm the results will be saved permanently.
模式的结果如何保存。可能的值是FF或BM。如果选择FF是数据将不会被自动保存。与BM的结果将永久保存。


参数：saveFile
Name of the file to save.
保存的文件名称。


参数：method
The method for the normalization.
标准化的方法。


值----------Value----------

An instance of ExpressionSet containing the non-polymorphic data of the microarray.
ExpressionSet含有芯片的非多态性数据的一个实例。


作者（S）----------Author(s)----------



Djork-Arne Clevert <a href="mailtokko@clevert.de">okko@clevert.de</a> and Andreas
Mitterecker <a href="mailto:mitterecker@bioinf.jku.at">mitterecker@bioinf.jku.at</a>




举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
library("hapmapsnp6")
celDir <- system.file("celFiles", package = "hapmapsnp6")
filenames <- dir(path = celDir, full.names = TRUE)
createAnnotation(filenames = filenames)
npData <- normalizeNpData(filenames)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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