mlSummarization(cn.farms)
mlSummarization()所属R语言包:cn.farms
Does summarization
是否总结
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Does summarization
是否总结
用法----------Usage----------
mlSummarization(object, windowMethod, windowParam,
summaryMethod, summaryParam,
callParam = list(runtype = "ff"), returnValues,
saveFile = "mlData")
参数----------Arguments----------
参数:object
an instance of ExpressionSet
一个ExpressionSet的实例
参数:windowMethod
Method for combination of neighbouring SNPs. Possible values are Std and Bps.
相邻的SNPs组合的方法。可能的值是STD和BPS。
参数:windowParam
further parameters as the window size
更多的参数为窗口的大小
参数:summaryMethod
allowed versions for the summarization step are: Gaussian, Variational, Exact. Default is Variational.
总结步允许的版本是:高斯,变,精确。默认是变的。
参数:summaryParam
summaryParam
summaryParam
参数:callParam
callParam
callParam
参数:returnValues
List with return values.
列出返回值。
参数:saveFile
Name of the file to save. For possible values see summaryMethod.
保存的文件名称。可能的值,见summaryMethod。
值----------Value----------
Some data
一些数据
作者(S)----------Author(s)----------
Djork-Arne Clevert <a href="mailtokko@clevert.de">okko@clevert.de</a> and Andreas
Mitterecker <a href="mailto:mitterecker@bioinf.jku.at">mitterecker@bioinf.jku.at</a>
举例----------Examples----------
load(system.file("exampleData/slData.RData", package = "cn.farms"))
windowMethod <- "std"
windowParam <- list()
windowParam$windowSize <- 5
windowParam$overlap <- TRUE
summaryMethod <- "Variational"
summaryParam <- list()
summaryParam$cyc <- c(20)
mlData <- mlSummarization(slData, windowMethod, windowParam,
summaryMethod, summaryParam)
assayData(mlData)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|