R语言 cn.farms包 dnaCopySf()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

dnaCopySf(cn.farms)
dnaCopySf()所属R语言包：cn.farms

                                        Runs DNAcopy in parallel mode
                                         运行在并行模式DNAcopy

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function even works very well with ff matrices,
该功能甚至可以很好与FF矩阵，


用法----------Usage----------


  dnaCopySf(x, chrom, maploc, cores = 1, smoothing, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
A matrix with data of the copy number experiments
具有套数实验数据矩阵


参数：chrom
The chromosomes (or other group identifier) from which the markers came
从该标记了染色体（或其他组标识符）


参数：maploc
The locations of marker on the genome
标记基因组上的位置


参数：cores
Number of cores to use
使用的核心数量


参数：smoothing
States if smoothing of the data should be done
国家如果平滑的数据应做


参数：...
Further parameter for the function segment of DNAcopy
进一步为的功能DNAcopy段参数


值----------Value----------

An instance of ExpressionSet containing the segments.
ExpressionSet包含段的实例。


作者（S）----------Author(s)----------



Djork-Arne Clevert <a href="mailtokko@clevert.de">okko@clevert.de</a> and Andreas
Mitterecker <a href="mailto:mitterecker@bioinf.jku.at">mitterecker@bioinf.jku.at</a>




举例----------Examples----------


load(system.file("exampleData/mlData.RData", package = "cn.farms"))
mlData <- mlData[, 1:3]
colnames(assayData(mlData)$L_z) <- sampleNames(mlData)
segments <- dnaCopySf(
        x         = assayData(mlData)$L_z,
        chrom     = fData(mlData)$chrom,
        maploc    = fData(mlData)$start,
        cores     = 1,
        smoothing = FALSE)
fData(segments)$data

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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