R语言 cn.farms包 combineData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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combineData(cn.farms)
combineData()所属R语言包：cn.farms

                                        Combine two ExpressionSet objects
                                         结合两个ExpressionSet对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Suitable for SNP or non-polymorphic data which were already processed with single locus FARMS
适合SNP或非多态性数据，其中已处理单基因农场


用法----------Usage----------


  combineData(object01, object02, obj01Var = "intensity",
    obj02Var = "intensity", runtype = "ff",
    saveFile = "combData")



参数----------Arguments----------

参数：object01
An instance of ExpressionSet either with SNP or non-polymorphic data
一个ExpressionSet无论是与实例SNP或非多态性数据


参数：object02
An instance of ExpressionSet either with SNP or non-polymorphic data
一个ExpressionSet无论是与实例SNP或非多态性数据


参数：obj01Var
States the variable which should be combined from the assayData slot. Default is intensity.
各国应结合从assayData插槽的变量。默认是强度。


参数：obj02Var
States the variable which should be combined from the assayData slot. Default is intensity.
各国应结合从assayData插槽的变量。默认是强度。


参数：runtype
Mode how the results are saved. Possible values are ff or bm. If ff is chosen the data will not be saved automatically. With bm the results will be saved permanently.
模式的结果如何保存。可能的值是FF或BM。如果选择FF是数据将不会被自动保存。与BM的结果将永久保存。


参数：saveFile
Name of the file to save.
保存的文件名称。


值----------Value----------

An instance of ExpressionSet.
ExpressionSet实例。


作者（S）----------Author(s)----------



Djork-Arne Clevert <a href="mailtokko@clevert.de">okko@clevert.de</a> and Andreas
Mitterecker <a href="mailto:mitterecker@bioinf.jku.at">mitterecker@bioinf.jku.at</a>




举例----------Examples----------


load(system.file("exampleData/normData.RData", package = "cn.farms"))
notes(experimentData(normData))$annotDir <-
        system.file("exampleData/annotation/pd.genomewidesnp.6/1.1.0",
                package = "cn.farms")
summaryMethod <- "Variational"
summaryParam <- list()
summaryParam$cyc <- c(10)
slData <- slSummarization(normData,
        summaryMethod = summaryMethod,
        summaryParam = summaryParam)
assayData(slData)$L_z[1:10, ]
combData <- combineData(slData, slData)
combData

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注：
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