R语言 clusterProfiler包 enrichKEGG()函数中文帮助文档(中英文对照)

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enrichKEGG(clusterProfiler)
enrichKEGG()所属R语言包：clusterProfiler

                                        KEGG Enrichment Analysis of a gene set.
                                         KEGG富集的基因组分析。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

KEGG Enrichment Analysis of a gene set. Given a vector of genes, this function will return the enrichment KEGG
KEGG富集的基因组分析。由于向量的基因，这个函数将返回浓缩KEGG


用法----------Usage----------


enrichKEGG(gene, organism="human", pvalueCutoff=0.05, readable=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：gene
a vector of entrez gene id.
Entrez基因身份证向量。


参数：organism
Currently, only "human" and "mouse" supported.
目前，只有“人”和“鼠标”的支持。


参数：pvalueCutoff
Cutoff value of pvalue.
临界值pvalue。


参数：readable
if readable is TRUE, the gene IDs will mapping to gene symbols. </table>
如果可读为TRUE，基因标识将映射到基因符号。 </ TABLE>


值----------Value----------

A enrichKEGGResult instance.
一个enrichKEGGResult实例。


作者（S）----------Author(s)----------


Guangchuang Yu <a href="http://ygc.name">http://ygc.name</a>



参见----------See Also----------

enrichKEGGResult-class, compareCluster
enrichKEGGResult-class，compareCluster


举例----------Examples----------


yy = enrichKEGG(gcSample[[5]], pvalueCutoff=0.01)
head(summary(yy))

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注：
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