enrichGO(clusterProfiler)
enrichGO()所属R语言包:clusterProfiler
GO Enrichment Analysis of a gene set.
GO富集的基因组分析。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
GO Enrichment Analysis of a gene set. Given a vector of genes, this function will return the enrichment GO
GO富集的基因组分析。由于向量的基因,这个函数将返回富集开始
用法----------Usage----------
enrichGO(gene, organism="human", ont="MF", pvalueCutoff=0.01, readable=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:gene
a vector of entrez gene id.
Entrez基因身份证向量。
参数:organism
Currently, only "human", "mouse" and "yeast" supported.
目前,只有“人”,“鼠标”和“酵母”的支持。
参数:ont
One of "MF", "BP", and "CC" subontologies.
“MF”,“BP”,“消委会”subontologies的之一。
参数:pvalueCutoff
Cutoff value of pvalue.
临界值pvalue。
参数:readable
if readable is TRUE, the gene IDs will mapping to gene symbols. </table>
如果可读为TRUE,基因标识将映射到基因符号。 </ TABLE>
值----------Value----------
A enrichGOResult instance.
一个enrichGOResult实例。
作者(S)----------Author(s)----------
Guangchuang Yu <a href="http://ygc.name">http://ygc.name</a>
参见----------See Also----------
enrichGOResult-class, compareCluster
enrichGOResult-class,compareCluster
举例----------Examples----------
#yy <- enrichGO(gcSample[[1]], organism="human", ont="BP", pvalueCutoff=0.01)[年年年年< - enrichGO(gcSample [1],机体=“人”,ONT =“BP”,pvalueCutoff = 0.01)]
#head(summary(yy))[头(摘要(日))]
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|