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求助:配对数据——差异检验

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发表于 2013-4-19 18:15:07 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 zc460 于 2013-4-19 18:16 编辑

我的数据如下:

组别                  自交系                 gene1               gene2                gene3               gene4
基因型A        inbred1        1417.57321        27048.46767        40.02116109        8.111716269
                inbred2        615.9848871        6027.391197        78.81959059        7.655039564
                inbred3        835.0363689        14866.0404        69.7674912        8.199416347

基因型a        inbred4        24.18951659        289.2844667        1.264419215        10.52182147
                inbred5        54.79376219        798.6766123        1.93509597        11.42727408
                inbred6        23.06889003        213.4098891        1.867210805        11.39448286
                inbred7        24.11387999        233.1627572        3.732804045        13.64469503
                inbred8        69.28536271        397.1775755        1.851929805        12.27998308

       以上数据是检测候选基因的基因型为A的3个自交系(1-3)、基因型为a的5个自交系(4-8)的下游4个基因的表达量。
实验所用的8个自交系遗传背景各不相同,因此即使候选基因的基因型相同也不能看作是简单地重复。4个下游基因在两种基因型下的表达量变化趋势不同,主要是gene1-3与gene4不同。

我的分析目的是:找出基因型A与基因型a中差异最大的两个自交系?

        针对上数据,我首先排除了paired t-test;然后,用wilcoxon signed-rang test的配对数据检验方法,发现数据变化趋势不同,因此这种方法也不可行。我自己查了一下,有人提出用Bayesian t-test的配对数据检验的方法,但是不太懂这个方法的原理,所以不知道怎么分析。

求赐教!!!!
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