STEM: Short Time-series expression_r Miner介绍

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STEM: Short Time-series expression_r Miner [http://www.cs.cmu.edu/~jernst/stem/]
STEM是一个Java 程序，用于聚类、比较和可视化短时间序列的基因表达数据(少于或等于8个时间点)。STEM允许研究者识别显著性的时间表达谱和与这些表达谱相关的基因，并比较不同条件下这些基因的行为。STEM完整地整合了GO数据库，并支持对具有相同的时间表达谱的基因集做GO类别富集分析。STEM还支持对特定GO 类别的基因行为进行简易的识别和可视化，识别在这些基因中那些时间表达谱被富集。