GoMiner and MatchMiner介绍

gene

GoMiner and MatchMiner [http://discover.nci.nih.gov/gominer/htgm.jsp]
High-Throughput GoMiner是一个工业级别的整合GO工具，用于解析多芯片实验。GOMiner是基于Java的程序包，对感兴趣的基因(如芯片实验里上调或下调基因)在GO的上下文里进行生物学解析。GoMiner提供定量和统计的输出文件和两个有用的可视化文件：(i)树状结构类似于AmiGO浏览器里所显示的(ii)一个压缩的，动态交互的DAG。GoMiner所展示的基因链接到主要的公开生物信息学资源。一个陪伴工具(companion)MatchMiner用于做前处理，为GoMiner或其它的GO工具的输入获取基因名称，提供了一个自动化脚本以便于安装本地化的数据库。