HT-GO-FAT:High Throughput Gene Ontology Functional Annotation Toolkit介绍

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HT-GO-FAT:High Throughput Gene Ontology Functional Annotation Toolkit [http://liru.ars.usda.gov/ht-go-fat.htm]
HT-GO-FAT允许高通量映射未知或其它基因序列如ESTs、mRNA、蛋白数据到GO注释、EC numbers、KEGG通路。它使用序列相似性和结构域匹配。此工具使用自定义的校正数据库以及拥有诸如窗口局域网分布式BLAST(windows LAN distributed BLAST)，能够通过窗口局域网分布高通量的BLAST搜索。HT-GO-FAT还拥有高通量的BLAST输出观察器，以及能对匹配度高或人工校正的数据导出为许多的文件格式。数据能导出为AmiGO相关的文件，通路图会高亮显示用户数据集中的酶/基因。