R语言 clippda包 replicateCorrelations()函数中文帮助文档(中英文对照)

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replicateCorrelations(clippda)
replicateCorrelations()所属R语言包：clippda

                                        A generic function to compute intraclass correlations
                                         一个通用的函数来计算内相关

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This generic function computes intraclass correlations for duplicate peak data.
这个通用函数计算重复的峰值数据内相关。


用法----------Usage----------


replicateCorrelations(Data, ...)



参数----------Arguments----------

参数：Data
An object of aclinicalProteomicsData  class.  
aclinicalProteomicsData类的对象。


参数：...
Some methods for this generic function may take additional, optional arguments.  At present none do.
这个泛型函数的一些方法可能需要额外的可选参数。目前没有做。


值----------Value----------


参数：consensus:
consensus intraclass correlation.
共识组内相关。


参数：correlations:
intraclass correlations for each peak.
每个峰内相关。


作者（S）----------Author(s)----------


Stephen Nyangoma



参考文献----------References----------

Billingham LJ: Sample size calculations for planning clinical proteomic profiling studies using mass spectrometry.  Bioinformatics (Submitted)
expression in microarray experiments. Bioinformatics 2005, 21, 2067 - 75
expression in microarray experiments. Stat Appl Genet Mol Biol 2004, 3, 1, Article 3

举例----------Examples----------


data(liverdata)

data(liver_pheno)

OBJECT=new("aclinicalProteomicsData")

OBJECT@rawSELDIdata=as.matrix(liverdata)
OBJECT@covariates=c("tumor" ,    "sex")
OBJECT@phenotypicData=as.matrix(liver_pheno)
OBJECT@variableClass=c('numeric','factor','factor')
OBJECT@no.peaks=53

replicateCorrelations(OBJECT)

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