R语言 xpose4data包 read.nm.tables()函数中文帮助文档(中英文对照)

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read.nm.tables(xpose4data)
read.nm.tables()所属R语言包：xpose4data

                                        Reading NONMEM table files
                                         阅读NONMEM表文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Reads one or more NONMEM table files, removes duplicated columns and merges the data into a data.frame.
读取一个或多个的NONMEM表文件，删除重复的列的数据合并到一个数据框。


用法----------Usage----------


read.nm.tables(table.files = NULL,
               runno = NULL,
               tab.suffix = "",
               table.names = c("sdtab", "mutab", "patab",
                               "catab", "cotab", "mytab",
                               "extra", "xptab"),
               cwres.name = c("cwtab"),
               cwres.suffix = "",
               quiet = FALSE,
               ...)



参数----------Arguments----------

参数：table.files
Exact names of table files to read.  If not provided then the exact names are created using the other arguments to the function.
精确读表文件名。如果没有提供的确切名称是使用其他参数的功能。


参数：runno
Run-number to identify sets of table files.
运行号来识别套表文件。


参数：tab.suffix
Table file name suffix.
表文件名后缀。


参数：table.names
Vector of template table file names to read.
向量的模板表文件名读。


参数：cwres.name
Vector of CWRES table file names to read.
向量的读CWRES表文件名。


参数：cwres.suffix
CWRES table file name suffix.
CWRES表文件名后缀。


参数：quiet
Logical value to indicate whether some warnings should be quiet or not.
一些警告逻辑值，指示是否应安静或不。


参数：...
Additional arguments passed to this function
额外的参数传递给这个函数


Details

详细信息----------Details----------

Reads one or more table files, removes duplicate columns and merges the data. The function also checks to see if the table files are of the same length (required).
读取一个或多个表文件，删除重复的列的数据合并。该功能还可以检查看如果表文件具有相同的长度（必需）。

If there are header lines in the table files (for example if your data are simulated with NSUB>1), these are removed.
如果有标题行的表文件（例如，如果您的数据是模拟N衬底1），这些都被删除。

The table file names to read are constructed from the file name templates of table.names. The runno and tab.suffix are appended to the file name template before checking if the file is readable.
读表文件名的文件名模板table.names构造。 runno和tab.suffix被附加到文件名模板前检查，如果该文件是可读的。

Xpose expects, by default, to find the following NONMEM tables in the working directory to be able to create an Xpose data object (using a run number of 5 as an example):
XPOSE预期，默认情况下，找到下面的NONMEM表中的工作目录是能够建立一个XPOSE数据对象（使用运行5号作为一个例子）：

sdtab5: The 'standard' parameters, including IWRE, IPRE, TIME, and the  NONMEM default items (DV, PRED, RES and WRES) that are added when  NOAPPEND is not present in the \$TABLE record.
sdtab5：“标准”的参数，包括IWRE，IPRE，时间和NONMEM默认项（DV PRED，RES和WRES），，时添加的NOAPPEND在\ $表中的记录是不存在的。

\$TABLE ID TIME IPRE IWRE    NOPRINT ONEHEADER FILE=sdtab5
\$TABLE ID TIME IPRE IWRE    NOPRINT ONEHEADER FILE=sdtab5

patab5: The empirical Bayes estimates of individual model parameter values, or posthoc estimates. These are model parameters, such as CL, V2, ETA1, etc.
patab5的经验Bayes估计各个模型的参数值，或进行事后估计。这些模型的参数，如CL，V2，ETA1等

\$TABLE ID CL V2 KA K F1 ETA1 ETA2 ETA3   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=patab5
\$TABLE ID CL V2 KA K F1 ETA1 ETA2 ETA3   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=patab5

catab5: Categorical covariates, e.g. SEX, RACE.
catab5：分类协变量，例如性别，种族。

\$TABLE ID SEX HIV GRP   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=catab5
\$TABLE ID SEX HIV GRP   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=catab5

cotab5: Continuous covariates, e.g. WT, AGE.
cotab5：连续协变量，例如WT，年龄。

\$TABLE ID WT AGE BSA HT GGT HB   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=cotab5
\$TABLE ID WT AGE BSA HT GGT HB   NOPRINT NOAPPEND ONEHEADER FILE=cotab5

mutab5, mytab5, extra5, xptab5: Additional variables of any kind. These might be useful if there are more covariates than can be accommodated in the covariates tables, for example, or if you have other variables that should be added, e.g. CMAX, AUC.        
mutab5，mytab5，extra5，xptab5其他任何形式的变量。这可能是有用的，如果有更多可容纳的协变量的在协变量表，例如，或者如果你有其他变量应该加入，例如： CMAX，AUC。


值----------Value----------

A data.frame.
数据框。


（作者）----------Author(s)----------


Niclas Jonsson, Andrew Hooker



参见----------See Also----------

xpose.data-class, compute.cwres
xpose.data-class，compute.cwres


实例----------Examples----------


## Not run: [＃不运行：]
## We expect to find the required NONMEM run and table files for run[＃我们希望找到所需的NONMEM运行和表文件运行的]
## 5 in the current working directory, and that the table files have[在当前的工作目录，第5和表文件]
## a suffix of '.dat', e.g. sdtab5.dat[＃后缀“。DAT”，例如： sdtab5.dat]

my.dataframe <- read.nm.tables(5, tab.suffix = ".dat")

## End(Not run)[＃（不执行）]


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