R语言 ChIPsim包 readQualitySample()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

readQualitySample(ChIPsim)
readQualitySample()所属R语言包：ChIPsim

                                         Sample read qualities from a list
                                         样品从列表读素质

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a read sequence and a list of read quality scores this function returns a (possibly truncated) quality score of the same length as the read.
鉴于只读序列和读取质量分数的名单，这个函数返回读一个相同长度的质量得分（可能被截断）。


用法----------Usage----------


readQualitySample(read, qualities, checkLength = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：read
A sequence read.  
读取序列。


参数：qualities
List of sequence read quality scores.  
名单顺序读质量分数。


参数：checkLength
Flag indicating whether the length of quality scores should be checked to ensure that they are at least as long as the read. If qualities contains entries shorter than read this has to be TRUE, but see below.   
标志，指示是否应检查，以确保他们只要至少读质量分数的长度。如果qualities包含的条目少于read这是TRUE，但是见下文。


参数：...
Further arguments, currently not used.  
进一步的论据，目前没有使用。


Details

详情----------Details----------

Using checkLength = TRUE leads to a substantial decrease in performance and is impractical for a large simulation. To avoid this slow down it is recommended to remove short sequences from qualities beforehand so that  checkLength = FALSE can be used.  
使用checkLength = TRUE导致在性能上的大幅下降，是一个大型模拟不切实际的。为了避免这种缓慢下降，建议从qualities事先让checkLength = FALSE可以用短序列。


值----------Value----------

An read quality score string of the same length as read.
一个阅读的质量得分相同的长度为read字符串。


作者（S）----------Author(s)----------



Peter Humburg


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。