laneSubsample(chipseq)
laneSubsample()所属R语言包:chipseq
Subsample short read alignment locations
子样本短读对齐位置
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Subsamples data from multiple lanes on a per-chromosome basis.
来自每个染色体的基础上的多车道的子样本数据。
用法----------Usage----------
laneSubsample(lane1, lane2, fudge = 0.05)
参数----------Arguments----------
参数:lane1, lane2
Two lanes of data, each of class "GenomeData".
两车道的数据,每个类"GenomeData"。
参数:fudge
A numeric fudge factor. For each chromosome, if the difference in the sizes relative to the size of the first dataset is less than fudge, no subsampling is done.
数字软糖的一个因素。对于每个染色体,不同的是,如果在第一个数据集的大小尺寸相对比fudge少,没有进行抽样。
值----------Value----------
laneSubsample returns a list similar to its input, but with the larger dataset subsampled to be similar to the smaller one.
laneSubsample返回一个列表,其输入类似,但具有较大的DataSet二次取样,以较小的一个是类似的。
作者(S)----------Author(s)----------
D. Sarkar
举例----------Examples----------
data(cstest)
## subsample to compare lanes[#子样本进行比较车道]
cstest.sub <- laneSubsample(cstest[[1]], cstest[[2]])
unlist(cstest.sub)
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