TOMplot(WGCNA)
TOMplot()所属R语言包:WGCNA
Graphical representation of the Topological Overlap Matrix
图形表示的拓扑重叠矩阵
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Graphical representation of the Topological Overlap Matrix using a heatmap plot combined with the corresponding hierarchical clustering dendrogram and module colors.
相应的层次聚类的聚类分析和模块的颜色结合使用HeatMap在图的拓扑重叠矩阵的图形表示。
用法----------Usage----------
TOMplot(
dissim,
dendro,
Colors = NULL,
ColorsLeft = Colors,
terrainColors = FALSE,
setLayout = TRUE,
...)
参数----------Arguments----------
参数:dissim
a matrix containing the topological overlap-based dissimilarity
矩阵的拓扑重叠的相异
参数:dendro
the corresponding hierarchical clustering dendrogram
相应的层次聚类的聚类分析
参数:Colors
optional specification of module colors to be plotted on top
可选模块的颜色规范被绘制在顶部
参数:ColorsLeft
optional specification of module colors on the left side. If NULL, Colors will be used.
模块颜色的左侧可选规范。如果NULL,Colors使用。
参数:terrainColors
logical: should terrain colors be used?
逻辑:应地形的颜色吗?
参数:setLayout
logical: should layout be set? If TRUE, standard layout for one plot will be used. Note that this precludes multiple plots on one page. If FALSE, the user is responsible for setting the correct layout.
逻辑:应布局?如果TRUE,标准的布局,将使用一个图。请注意,这排除了多条曲线在一个页面上。如果FALSE,用户是负责设置正确的布局。
参数:...
other graphical parameters to heatmap.
其他图形参数到heatmap。
Details
详细信息----------Details----------
The standard heatmap function uses the layout function to set the following layout (when Colors is given):
标准heatmap函数使用layout功能的设置的布局(Colors):
值----------Value----------
None.
无。
(作者)----------Author(s)----------
Steve Horvath and Peter Langfelder
参见----------See Also----------
heatmap, the workhorse function doing the plotting.
heatmap,做策划的主力功能。
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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