simulateEigengeneNetwork(WGCNA)
simulateEigengeneNetwork()所属R语言包:WGCNA
Simulate eigengene network from a causal model
模拟eigengene网络的因果模型
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Simulates a set of eigengenes (vectors) from a given set of causal anchors and a causal matrix.
模拟从因果锚和一个因果矩阵的一组给定的一组特征基因(向量)。
用法----------Usage----------
simulateEigengeneNetwork(causeMat, anchorIndex, anchorVectors, noise = 1, verbose = 0, indent = 0)
参数----------Arguments----------
参数:causeMat
causal matrix. The entry [i,j] is the influence (path coefficient) of vector j on vector i.
因果矩阵。进入[i,j]的影响(通径系数)矢量j向量i。
参数:anchorIndex
specifies the indices of the anchor vectors.
指定锚定矢量的指数,其中。
参数:anchorVectors
a matrix giving the actual anchor vectors as columns. Their number must equal the length of anchorIndex.
矩阵给列的实际锚向量。他们的人数必须相等的长度anchorIndex。
参数:noise
standard deviation of the noise added to each simulated vector.
标准偏差的噪声添加到每个模拟矢量。
参数:verbose
level of verbosity. 0 means silent.
的详细程度。 0表示沉默。
参数:indent
indentation for diagnostic messages. Zero means no indentation; each unit adds two spaces.
缩进诊断消息。零表示没有缩进,每个单元增加两个空格。
Details
详细信息----------Details----------
The algorithm starts with the anchor vectors and iteratively generates the rest from the path coefficients given in the matrix causeMat.
该算法开始的锚向量和,迭代产生其余的路径系数矩阵中的causeMat。
值----------Value----------
A list with the following components:
以下组件列表:
参数:eigengenes
generated eigengenes.
生成的特征基因。
参数:causeMat
a copy of the input causal matrix
输入的一个副本的因果矩阵
参数:levels
useful for debugging. A vector with one entry for each eigengene giving the number of generations of parents of the eigengene. Anchors have level 0, their direct causal children have level 1 etc.
对调试有用。一个向量,其为每个eigengene数代父母的eigengene一个项目。锚0级,其直接的因果儿童有1级等
参数:anchorIndex
a copy of the input anchorIndex.
的副本输入anchorIndex。
(作者)----------Author(s)----------
Peter Langfelder
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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