R语言 WGCNA包 propVarExplained()函数中文帮助文档(中英文对照)

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propVarExplained(WGCNA)
propVarExplained()所属R语言包：WGCNA

                                         Proportion of variance explained by eigengenes.
                                         解释方差的特征基因的比例。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function calculates the proportion of variance of genes in each module explained by the respective module eigengene.
此函数计算基因变异的比例由各自的模块eigengene的每个模块中的解释。


用法----------Usage----------


propVarExplained(datExpr, colors, MEs, corFnc = "cor", corOptions = "use = 'p'")



参数----------Arguments----------

参数：datExpr
  expression data. A data frame in which columns are genes and rows ar samples. NAs are allowed and will be ignored.  
表达数据。一个数据框的基因，在哪些列和行AR样本。来港定居是允许的，将被忽略。


参数：colors
a vector giving module assignment for genes given in datExpr. Unique values should correspond to the names of the eigengenes in MEs.  
模块分配一个向量的基因在datExpr。唯一值对应的特征基因在MEs的名称。


参数：MEs
a data frame of module eigengenes in which each column is an eigengene and each row corresponds to a sample.   
模块特征基因的数据框，其中每一列是一个eigengene和每一行对应于一个样本。


参数：corFnc
character string containing the name of the function to calculate correlation. Suggested functions include "cor" and "bicor".  
含有计算相关的函数名称的字符串。建议功能包括"cor"和"bicor"。


参数：corOptions
further argument to the correlation function.  
进一步的相关函数的参数。


Details

详细信息----------Details----------

For compatibility with other functions, entries in color are matched to a substring of names(MEs) starting at position 3. For example, the entry "turquoise" in colors will be matched to the eigengene named "MEturquoise". The first two characters of the eigengene name are ignored and can be arbitrary.
其他功能，项目的兼容性color相匹配的子串names(MEs)开始在第3位。例如，进入"turquoise"，在colors将匹配到名为"MEturquoise"eigengene。前两个字符的eigengene名称被忽略，并且可以随心所欲。


值----------Value----------

A vector with one entry per eigengene containing the proportion of variance of the module explained by the eigengene.
一个向量，其每一个条目包含的模块的方差的比例eigengene的eigengene解释。


（作者）----------Author(s)----------


Peter Langfelder



参见----------See Also----------

moduleEigengenes
moduleEigengenes

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注：
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