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R语言 WGCNA包 overlapTable()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-10-1 21:20:22 | 显示全部楼层 |阅读模式
overlapTable(WGCNA)
overlapTable()所属R语言包:WGCNA

                                         Calculate overlap of modules
                                         计算重叠的模块

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function calculates overlap counts and Fisher exact test p-values for the given two sets of module assignments.
该函数计算重叠数和Fisher精确检验的p值给定的两组模块分配。


用法----------Usage----------


overlapTable(labels1, labels2)



参数----------Arguments----------

参数:labels1
a vector containing module labels.  
一个向量,包含模块的标签。


参数:labels2
a vector containing module labels to be compared to labels1.  
一个向量,包含模块的标签相比labels1。


值----------Value----------

A list with the following components:
以下组件列表:


参数:countTable
a matrix whose rows correspond to modules (unique labels) in labels1 and whose columns correspond to modules (unique labels) in labels2, giving the number of objects in the intersection of the two respective modules.  
行的矩阵,其对应于在labels1和其列在labels2,对应于模块(唯一的标签)的模块(唯一的标签),给予的交点的两个相应的模块中的对象数。


参数:pTable
a matrix whose rows correspond to modules (unique labels) in labels1 and whose columns correspond to modules (unique labels) in labels2, giving Fisher's exact test  significance p-values for the overlap of the two respective modules.  
矩阵的行labels1和列对应的模块(唯一的标签),对应的模块(唯一的标签)labels2,Fisher精确检验意义的p值重叠的两个相应的模块。


(作者)----------Author(s)----------


Peter Langfelder



参见----------See Also----------

fisher.test, matchLabels
fisher.test,matchLabels

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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