intramodularConnectivity(WGCNA)
intramodularConnectivity()所属R语言包：WGCNA
Calculation of intramodular connectivity
intramodular的连接的计算
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Calculates intramodular connectivity, i.e., connectivity of nodes to other nodes within the same module.
计算intramodular连接，即，在同一模块内的其他节点的节点的连接。
用法----------Usage----------
intramodularConnectivity(adjMat, colors, scaleByMax = FALSE)
参数----------Arguments----------
参数：adjMat
adjacency matrix, a square, symmetric matrix with entries between 0 and 1.
邻接矩阵，正方形，与在0和1之间的条目的对称矩阵。
参数：colors
module labels. A vector of length ncol(adjMat) giving a module label for each gene (node) of the network.
模块的标签。长度ncol(adjMat)给每个基因（节点）的网络的模块标签的向量。
参数：scaleByMax
logical: should intramodular connectivities be scaled by the maximum IM connectivity in each module?
逻辑：最大的IM在每个模块的连接应intramodular的连通进行调整的？
Details
详细信息----------Details----------
The module labels can be numeric or character. For each node (gene), the function sums adjacency entries (excluding the diagonal) to other nodes within the same module. Optionally, the connectivities can be scaled by the maximum connectivy in each module.
该模块标签可以是数字或字符。对于每个节点（基因），该函数求和邻接条目（不包括对角线）在同一模块内的其他节点。任选地，所述连通性可以由在每个模块中的最大connectivy缩放。
值----------Value----------
A data frame with 4 columns giving the total connectivity, intramodular connectivity, extra-modular connectivity, and the difference of the intra- and extra-modular connectivities for all genes.
一个4列给总连接，intramodular的连接，额外的模块化连接，所有基因的差异，连通内外的模块化数据框。
（作者）----------Author(s)----------
Steve Horvath and Peter Langfelder
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
adjacency
adjacency
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-10-1 21:15:20
