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R语言 WGCNA包 cutreeStatic()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-10-1 21:12:17 | 显示全部楼层 |阅读模式
cutreeStatic(WGCNA)
cutreeStatic()所属R语言包:WGCNA

                                         Constant-height tree cut
                                         的恒高树切

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Module detection in hierarchical dendrograms using a constant-height tree cut. Only branches whose size is at least minSize are retained.
模块检测层次的树状图,使用的是恒高树砍。只有分支的大小至少minSize保留。


用法----------Usage----------


cutreeStatic(dendro, cutHeight = 0.9, minSize = 50)



参数----------Arguments----------

参数:dendro
a hierarchical clustering dendrogram such as returned by hclust.  
分层聚类树状图如返回hclust。


参数:cutHeight
height at which branches are to be cut.  
高度分支将会被削减。


参数:minSize
minimum number of object on a branch to be considered a cluster.  
的对象被认为是一个聚类的一个分支上的最小数目。


Details

详细信息----------Details----------

This function performs a straightforward constant-height cut as implemented by cutree, then calculates the number of objects on each branch and only keeps branches that have at least minSize objects on them.
这个函数执行一个简单的恒定高度削减所实现的cutree,然后计算每个分支上的对象的数量,只保留至少有minSize对象对他们的分支机构。


值----------Value----------

A numeric vector giving labels of objects, with 0 meaning unassigned. The largest cluster is conventionally labeled 1, the next largest 2, etc.
指定给标签的对象,0表示一个数字矢量。最大的聚类以往标记为1,下一个最大的2,等等。


(作者)----------Author(s)----------


Peter Langfelder



参见----------See Also----------

hclust for hierarchical clustering, cutree and cutreeStatic for other constant-height branch cuts, standardColors to convert
hclust层次聚类,cutree和cutreeStatic其他的恒定高度分支切割,standardColors转换

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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