找回密码
 注册
查看: 885|回复: 0

R语言 WGCNA包 correlationPreservation()函数中文帮助文档(中英文对照)

[复制链接]
发表于 2012-10-1 21:11:56 | 显示全部楼层 |阅读模式
correlationPreservation(WGCNA)
correlationPreservation()所属R语言包:WGCNA

                                         Preservation of eigengene correlations
                                         保存eigengene的相关性

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculates a summary measure of  preservation of eigengene correlations across data sets
计算的汇总数据集之间的eigengene相关的保护措施


用法----------Usage----------


correlationPreservation(multiME, setLabels, excludeGrey = TRUE, greyLabel = "grey")



参数----------Arguments----------

参数:multiME
consensus module eigengenes in a multi-set format. A vector of lists with one list corresponding to each set. Each list must contain a component data that is a data frame whose columns are consensus module eigengenes.   
共识模块中的多组的格式的特征基因。一个列表,对应于各组的向量列表。每个列表都必须包含data这是一个数据框的列共识模块特征基因的一个组成部分。


参数:setLabels
names to be used for the sets represented in multiME.
名称被用于在multiME表示的集。


参数:excludeGrey
logical: exclude the 'grey' eigengene from preservation measure?
逻辑:排除“灰色”eigengene的保全措施?


参数:greyLabel
module label corresponding to the 'grey' module. Usually this will be the character string "grey" if the labels are colors, and the number 0 if the labels are numeric.
模块标签对应的“灰色”模块。通常这将是字符串"grey",如果标签的颜色和数字0,如果标签数字。


Details

详细信息----------Details----------

The function calculates the preservation of correlation of each eigengene with all other eigengenes (optionally except the 'grey' eigengene) in all pairs of sets.  
该函数计算的的每个eigengene相关,与所有其他特征基因(可选除的“灰色”eigengene的外)在所有双套保护。


值----------Value----------

A data frame whose rows correspond to consensus module eigengenes given in the input multiME, and columns correspond to all possible set comparisons. The two sets compared in each column are indicated in the column name.
一个数据框的行对应的共识模块特征基因输入multiME,列对应于所有可能的比较。两组相比,在每一列的列名中表示。


(作者)----------Author(s)----------


Peter Langfelder



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

multiSetMEs and modulecheckSets in package moduleColor for
multiSetMEs模块checkSets在包moduleColor中

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

手机版|小黑屋|生物统计家园 网站价格

GMT+8, 2024-11-25 08:24 , Processed in 0.022762 second(s), 15 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表