R语言 WGCNA包 consensusMEDissimilarity()函数中文帮助文档(中英文对照)

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consensusMEDissimilarity(WGCNA)
consensusMEDissimilarity()所属R语言包：WGCNA

                                         Consensus dissimilarity of module eigengenes.
                                         模块特征基因的共识相异的。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculates consensus dissimilarity (1-cor) of given module eigengenes relaized in several sets.
计算共识相异(1-cor)给定的模块的特征基因relaized几套。


用法----------Usage----------


consensusMEDissimilarity(MEs, useAbs = FALSE, useSets = NULL, method = "consensus")



参数----------Arguments----------

参数：MEs
Module eigengenes of the same modules in several sets.  
模块特征基因在多套相同的模块。


参数：useAbs
Controls whether absolute value of correlation should be used instead of correlation in the calculation of dissimilarity.  
控制是否应使用绝对相关值的相关性，而不是计算相异。


参数：useSets
If the consensus is to include only a selection of the given sets, this vector (or scalar in the case of a single set) can be used to specify the selection. If NULL, all sets will be used.  
如果是只包括一个选择的给定集的共识，该向量（或单一的一套中的标量的情况下），可以使用以指定选择。如果NULL，所有集将被使用。


参数：method
A character string giving the method to use. Allowed values are (abbreviations of)  "consensus" and "majority". The consensus dissimilarity is calculated as the minimum of given set dissimilarities for "consensus" and as the average for "majority".
一个字符串的方法使用。允许值（缩写）"consensus"和"majority"。计算的最低给定相异的"consensus"和的平均为"majority"的共识相异。


Details

详细信息----------Details----------

This function calculates the individual set dissimilarities of the given eigengenes in each set, then takes the (parallel) maximum or average over all sets. For details on the structure of imput data, see checkSets.
此函数计算个别设定不同点，然后在每一组给定的特征基因（平行）的最大或平均超过所有集合。种输入数据的结构的详细信息，请参阅checkSets。


值----------Value----------

A dataframe containing the matrix of dissimilarities, with names and rownames set appropriately.
一个数据框包含矩阵的不同点，与names和rownames设置适当。


（作者）----------Author(s)----------



Peter Langfelder, <a href="mailtoeter.Langfelder@gmail.com">eter.Langfelder@gmail.com</a>




参见----------See Also----------

checkSets
checkSets

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