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R语言 WGCNA包 checkSets()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-10-1 21:08:36 | 显示全部楼层 |阅读模式
checkSets(WGCNA)
checkSets()所属R语言包:WGCNA

                                        Check structure and retrieve sizes of a group of datasets.  
                                         检查结构和检索的一组数据集的大小。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Checks whether given sets have the correct format and retrieves dimensions.
给套检查是否有正确的格式和检索的尺寸。


用法----------Usage----------


checkSets(data, checkStructure = FALSE, useSets = NULL)



参数----------Arguments----------

参数:data
A vector of lists; in each list there must be a component named data whose content is a matrix or dataframe or array of dimension 2.  
一个向量的列表,每个列表中必须有一个名为data“,其内容是一个矩阵或数据框或数组的维数为2的组件。


参数:checkStructure
If FALSE, incorrect structure of data will trigger an error. If TRUE, an appropriate flag (see output) will be set to indicate whether data has correct structure.
如果FALSE,data不正确的结构将触发一个错误。如果TRUE,相应的标志(见输出)将被设置是否data有正确的结构。


参数:useSets
Optional specification of entries of the vector data that are to be checked. Defaults to all components. This may be useful when data only contains information for some of the sets.
可选规范矢量data是要检查的条目。默认的所有组件。时data只包含套的信息,这可能是有用的。


Details

详细信息----------Details----------

For multiset calculations, many quantities (such as expression data, traits, module eigengenes etc) are presented by a common structure, a vector of lists (one list for each set) where each list has a component data that contains the actual (expression, trait, eigengene) data for the corresponding set in the form of a dataframe. This funtion checks whether data conforms to this convention and retrieves some basic dimension information (see output).
对于multiset的计算,许多的数量(如基因表达数据,性状,模块特征基因等)是由一个共同的结构,一个向量的列表(一个为每个集列表)列表,其中每个有一个组件包含data实际(表达式,性状,eigengene)的对应的一组数据的形式的数据框。这FUNTION检查是否data符合本公约,并获取一些基本的尺寸信息(输出)。


值----------Value----------

A list with components
组件列表


参数:nSets
Number of sets (length of the vector data).
数套(长度的向量data)。


参数:nGenes
Number of columns in the data components in the lists. This number must be the same for all sets.
数列data组件列表。所有套,这个数字必须是相同的。


参数:nSamples
A vector of length nSets giving the number of rows in the data components.
一个向量的长度nSets的行数在data组件。


参数:structureOK
Only set if the argument checkStructure equals TRUE.  The value is TRUE if the paramter data passes a few tests of its structure, and FALSE otherwise. The tests are not exhaustive and are meant to catch obvious user errors rather than be bulletproof.
仅设置,如果参数checkStructure等于TRUE。该值是TRUE如果data放慢参数通过一些测试,它的结构,FALSE否则。这些测试是不彻底的,是为了找出明显的错误,而不是成为用户防弹。


(作者)----------Author(s)----------



Peter Langfelder, <a href="mailtoeter.Langfelder@gmail.com">eter.Langfelder@gmail.com</a>


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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