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R语言 WGCNA包 BrainRegionMarkers()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-10-1 21:08:24 | 显示全部楼层 |阅读模式
BrainRegionMarkers(WGCNA)
BrainRegionMarkers()所属R语言包:WGCNA

                                        Gene Markers for Regions of the Human Brain
                                         基因标记的人脑区域

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This matrix gives a predefined set of marker genes for many regions of the human brain, using data from the Allen Human Brain Atlas (http://human.brain-map.org/) as reported in: Hawrylycz MJ, Lein ES, Guillozet-Bongaarts AL, Shen EH, Ng L, Miller JA, et al. (2012) An Anatomically Comprehensive Atlas of the Adult Human Brain Transcriptome. Nature (in press).  It is used with userListEnrichment to search user-defined gene lists for enrichment.
这个矩阵给出了一组预定义的标记基因的许多区域,人类的大脑,艾伦人脑阿特拉斯(http://human.brain-map.org/),使用数据的报告:Hawrylycz MJ,雷音ES,Guillozet邦加茨AL,沉EH,吴L,米勒JA等。 (2012年)解剖学综合图集成人大脑的转录。自然(出版中)。它是用来与userListEnrichment搜索用户定义的基因列表富集。


用法----------Usage----------


data(BrainRegionMarkers)



格式----------Format----------

A 28477 x 2 matrix of characters containing Gene / Category pairs.  The first column (Gene) lists genes corresponding to a given category (second column).  Each Category entry is of the form <Brain Region>_<Marker Type>__HBA.  Note that the matrix is sorted first by Category and then by Gene, such that all genes related to the same category are listed sequentially.
一个28477×2矩阵的字符,包含基因/类别对。的第一列(基因)的列表对应于一个给定的类别(第二列)的基因。每个类别项是的形式<Brain区域的_ <marker类型> __HBA。请注意,矩阵排序第一个类别,然后通过基因的同一类别的所有相关基因的顺序列出。


源----------Source----------

For references used in this variable, or other information, please see userListEnrichment
对于参考使用这个变量,或其他信息,请参阅userListEnrichment


实例----------Examples----------


data(BrainRegionMarkers)
head(BrainRegionMarkers)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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