R语言 VLMC包 bnrf1()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

bnrf1(VLMC)
bnrf1()所属R语言包：VLMC

                                        BNRF1 Gene DNA sequences: Epstein-Barr and Herpes
                                         BNRF1基因的DNA序列：爱泼斯坦 - 巴尔和疱疹

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Two gene DNA data “discrete time series”,   
两个基因的DNA数据“离散的时间序列”，

bnrf1EBthe BNRF1 gene from the Epstein-Barr virus,
bnrf1EB的BNRF1的基因从Epstein-Barr病毒，

bnrf1HVthe BNRF1 gene from the herpes virus.   
bnrf1HV的BNRF1基因疱疹病毒。


用法----------Usage----------


data(bnrf1)



格式----------Format----------

The EB sequence is of length 3954, whereas the HV has 3741 nucleotides. Both are R factors with the four levels c("a","c","g","t").
的EB顺序是length3954，而HV有3741个核苷酸。两者都是Rfactor的与四个层次c("a","c","g","t")。


（作者）----------Author(s)----------


Martin Maechler (packaging for <font face="Courier New,Courier" color="#666666"><b>R</b></font>).



源----------Source----------

See the references, data are online at http://anson.ucdavis.edu/~shumway/tsa.html
请参考相关手册，数据在线http://anson.ucdavis.edu/~沙姆韦/ tsa.html，


参考文献----------References----------

Shumway, R. and Stoffer, D. (2000) Time Series Analysis and its Applications. Springer Texts in Statistics.

实例----------Examples----------


data(bnrf1)
bnrf1EB[1:500]
table(bnrf1EB)
table(bnrf1HV)
n <- length(bnrf1HV)
table(t = bnrf1HV[-1], "t-1" = bnrf1HV[-n])

plot(as.integer(bnrf1EB[1:500]), type = "b")


## Simplistic gene matching:[＃简单化的基因匹配：]
percent.eq <- sapply(0:200,
           function(i) 100 * sum(bnrf1EB[(1+i)n+i)] ==  bnrf1HV))/n
plot.ts(percent.eq)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。