sim.groups(vegetarian)
sim.groups()所属R语言包：vegetarian
Within- and Between-Group Similarities
内和组间的相似
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given two groups with multiple samples (e.g. sites, plots) the sim.groups function calculates all possible pairwise combinations of within- and between-group comparisons.
由于两组多个样品（如网站，图）sim.groups函数计算所有可能的配对组合内和组间比较。
用法----------Usage----------
sim.groups(abundances1, abundances2, q = 1, labels = FALSE, boot = FALSE, boot.arg = list(s.sizes = NULL, num.iter = 100))
参数----------Arguments----------
参数：abundances1
Community data as a matrix where columns are individual species and rows are sites or a vector of different species within a site. Matrix and vector elements are abundance data (e.g. counts, percent cover estimates).
数据列是一个矩阵，其中个别品种和行的社区网站或网站内的不同品种的一个向量。矩阵和向量元素的丰度数据（如计数，百分比盖的估计）。
参数：abundances2
Community data, a vector of different species within a site. Vector elements are abundance data (e.g. counts, percent cover estimates). If abundances1 is given a matrix, then abundances2 defaults to a logical FALSE statement.
社区站点内的数据，不同物种的向量。 Vector元素的丰度数据（如计数，百分比盖的估计）。如果abundances1给出一个矩阵，然后abundances2默认为一个逻辑的虚假陈述。
参数：q
Order of the diversity measure. Defaults to the Shannon case where q = 1.
订购的多样性的措施。默认的Shannon情况下，q = 1时。
参数：labels
Logical statement. If labels=TRUE, then site names are given as the first column of the abundance matrix. The default is labels=FALSE where no site names are given in the abundance matrix.
逻辑语句。如果标签= TRUE，那么站点名称给出的丰度矩阵的第一列。默认值是标签= FALSE没有网站名称的丰度矩阵。
参数：boot
Logical indicating whether to use bootstrapping to estimate uncertainty. If boot=TRUE, only standard errors will be output in table; to get both values and standard error of similarities, must call sim.groups twice, setting boot to both TRUE and FALSE
逻辑指示是否使用自举到估计不确定性。如果引导= TRUE，标准误差将输出表中值和标准错误的相似性，必须调用sim.groups两次，将启动设置为TRUE和FALSE
参数：boot.arg
(optional) List of arguments to pass bootstrapping function: list(s.sizes=number you specify, num.iter=number you specify)
（可选）的参数列表，通过自举功能：列表（s.sizes =您指定的号码，num.iter =您指定的号码）
Details
详细信息----------Details----------
Depending on the specification of the order (q), other different similarity indices may be calculated (e.g. Sorenson index when q=0, Horn index when q=1, Morisita-Horn index when q=2) (Jost 2007).
根据规范的顺序（q），其他不同的相似性指数计算（例如Sorenson指数q = 0时，喇叭指数当q = 1时，Morisita角指数当q = 2）（乔斯特2007）。
值----------Value----------
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>within.1</td> <td> Within-group similarities (or standard errors) for first group.</td></tr> <tr valign="top"><td>within.2</td> <td> Within-group similarities (or standard errors) for second group.</td></tr> <tr valign="top"><td>between</td> <td> Between group similarities (or standard errors).</td></tr> </table>
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> within.1</ TD> <TD>组内的相似性（或标准差）为第一组。</ TD> < / TR> <tr valign="top"> <TD> within.2 </ TD> <TD>组内相似性（或标准误）为第二组。</ TD> </ TR> <TR VALIGN =“顶”> <TD> between </ TD> <TD>组之间的相似性（或标准错误）。</ TD> </ TR> </ TABLE>
（作者）----------Author(s)----------
Noah Charney, Sydne Record
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3> <code>similarity</code>, <code>sim.table</code>
实例----------Examples----------
data(simesants)
sim.groups(simesants[1:3,],simesants[4:5,],labels=TRUE,boot=TRUE)
sim.groups(simesants[1:3,-1],simesants[4:5,-1])
sim.groups(simesants[1:3,-1],simesants[4:5,-1],labels=TRUE,boot=TRUE)#gives standard errors only[只提供标准的错误]
sim.groups(simesants[1:3,-1],simesants[4:5,-1],labels=TRUE,boot=TRUE,boot.arg=list(num.iter=200))#gives standard errors only[只提供标准的错误]
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-10-1 15:19:26
