R语言 vegdata包 tv.veg()函数中文帮助文档(中英文对照)

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tv.veg(vegdata)
tv.veg()所属R语言包：vegdata

                                        Tabulates vegetation tables from Turboveg database
                                         从Turboveg数据库列表植被表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Tabulates vegetation tables from Turboveg resp. VegetWeb database, including taxonomic emendation and layer combination. Using various default parameters for the included functions.
列表植被表RESP从Turboveg。 VegetWeb数据库，包括的分类校正和层组合。使用各种默认参数所包含的功能。


用法----------Usage----------


tv.veg(db, tv_home, taxval = TRUE, convcode=TRUE, lc = c("layer", "mean", "max", "sum", "first"), pseudo = list(lc.1, "LAYER"), values='COVER_PERC', concept, spcnames=c('short','long','numbers'), dec = 0, cover.transform = c('no', 'pa', 'sqrt'), obs, refl, spc, site, RelScale, ...)



参数----------Arguments----------

参数：db
Name of your Turboveg database. Directory name containing tvabund.dbf, tvhabita.dbf and tvwin.set. Please specify pathnames below (if you sorted your databases in subfolders) but not above Turbowin/Data.
你的Turboveg的数据库的名称。目录名含有tvabund.dbf，tvhabita.dbf和tvwin.set。下面请指定路径名（如果你整理你的数据库的子文件夹中），但不，上面Turbowin /数据。


参数：tv_home
Turbowin installation path.
Turbowin的安装路径。


参数：taxval
Should taxonomic valuation (see taxval) be performed?
分类估值（见taxval）进行？


参数：convcode
Should cover code be converted to percentage values?
应包括代码转换为百分比值吗？


参数：lc
Layer combination type. Possible values: layer (default), sum, mean or max, see details
层组合型。可能的值：层（默认），总和，平均最大，详见


参数：pseudo
List used for layer combinations, see details
列出层组合使用，查看详情


参数：values
Name of the variable which should be used for the vegetations matrix.
应用于植被矩阵的变量的名称。


参数：concept
Name of alternative taxon concept list, see vignette(vegdata)
替代类群概念名称的列表，请参阅vignette(vegdata)


参数：spcnames
Should species numbers be replaced by shortletters or real names?
物种数量所取代shortletters或真实姓名吗？


参数：dec
Number of decimals for cover values in the resulting vegetation matrix.
产生的植被盖度小数数矩阵。


参数：cover.transform
If you want to transform the abundancce values within your samples you can choose 'pa' for presence-absnece or 'squareroot' for the dec rounded square root.
如果您希望您的样品改造abundancce的值内，您可以选择“为的存在absnece或”平方根“dec圆角方形根。


参数：obs
Observations, optional
观测，可选


参数：refl
Taxonomic reference list, optional
分类参考列表，可选


参数：spc
If you want to pick a subset of species.
如果你想选择一个子集的物种。


参数：site
Dataframe with site informations.
数据框与网站的信息。


参数：RelScale
Vector with Cover Scale code per Releve.
向量的封面规模每Releve代码。


参数：...
additional arguments for included functions
额外的参数包含的功能


Details

详细信息----------Details----------

layer means, the different layers are combined assuming there independence (a species occuring in two layers with a cover of 50% will result in a overall cover of 75%. sum will sum up cover values of all layers
layer装置，不同的层组合假设有独立性（发生在两个层的盖50％，将导致一个物种中的75％的整体盖。sum将总结盖的所有值层

With option pseudo you can decide, which layers should be combined. Give a list with a combination data.frame  (see lc and second the name of the column for combination. For an example see pseudo = list(lc.1,c('LAYER')). With option pseudo=NULL there will be no layer aggregation. \ For further details see also tv.coverperc and taxval.
选项“pseudo，”你可以决定的，这层应结合。给的组合数据框的列表（见lc的名称，第二列组合。举一个例子，看到pseudo = list(lc.1,c('LAYER'))。选项伪= NULL有没有层聚合。\进一步的详细信息，请参阅tv.coverperc和taxval。


值----------Value----------

Function returns an object of class matrix with (combined) cover values.
函数返回一个对象的类矩阵（合并）盖度。


（作者）----------Author(s)----------


Florian Jansen
<a href="mailto:jansen@uni-greifswald.de">jansen@uni-greifswald.de</a>




实例----------Examples----------


## Not run: vignette("vegdata")[＃不运行：小插曲（“vegdata”）]
# If you have Turboveg installed on your computer try for a beginning tv.veg('databasename', tax=FALSE).[如果，你已经Turboveg安装在您的计算机上尝试一个的开始tv.veg（数据库名称，税= FALSE）。]
args(tv.veg)
args(tv.taxval)

veg <- tv.veg('taxatest', sysPath=TRUE)
names(veg)
tv.veg('taxatest', uncertain=list('DET_CERT', data.frame(0:2,c('pres','agg','agg'))), pseudo=list(lc.0,'LAYER'), genus = 'delete', sysPath=TRUE)

## End(Not run)[＃（不执行）]

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注：
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