R语言 vegan包 make.cepnames()函数中文帮助文档(中英文对照)

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make.cepnames(vegan)
make.cepnames()所属R语言包：vegan

                                        Abbreviates a Botanical or Zoological Latin Name into an Eight-character Name
                                         到八个字符的名称缩写一个植物或动物的拉丁名

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A standard CEP name has four first letters of the generic name and four first letters of the specific epithet of a Latin name. The last epithet, that may be a subspecific name, is used in the current function. If the name has only one component, it is abbreviated to eight characters (see abbreviate). The returned names are made unique with function make.unique which adds numbers to the end of CEP names if needed.
一个标准的CEP名中有四个通用名称的第一个字母和四个特定称号的拉丁名称的第一个字母。最后的称号，这可能是一个亚种名，是用来在当前的功能。如果名称中的一个组成部分，它是缩写为八个字符（见abbreviate）。返回的名称与功能make.unique的的CEP名结束，如果需要添加数字都是独特的。


用法----------Usage----------


make.cepnames(names, seconditem = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：names
The names to be formatted into CEP names.  
的名称被格式化到CEP名。


参数：seconditem
Take always the second item of the original name to the abbreviated name instead of the last original item (default).
第二项的原始名称的缩写名称，而不是最后的原稿项目（默认）。


Details

详细信息----------Details----------

Cornell Ecology Programs (CEP) used eight-letter abbreviations for species and site names. In species, the names were formed by taking four first letters of the generic name and four first letters of the specific or subspecific epithet. The current function first makes valid R names using make.names, and then splits these into elemets. The CEP name is made by taking the four first letters of the first element, and four first letters of the last (default) or the second element (with seconditem =   TRUE). If there was only one name element, it is abbreviated to eight letters. Finally, the names are made unique which may add numbers to duplicated names.
康乃尔大学生态学计划（CEP）使用8个字母的缩写物种和站点名称。在种类，名称，形成的通用名称的第一个字母和四个特定或亚种加词的第一个字母。目前的功能有效的R名称，使用make.names，然后分裂成elemets的。 CEP名称的第一个字母的第一个元素是由第一个字母的最后一个（默认）或第二个元素（用seconditem =   TRUE）4。如果只有一个name元素，它是abbreviateD到八个字母。最后，名字都是独特的，可能会增加重复名称的数字。

The CEP names were originally used, because old FORTRAN IV did not have CHARACTER data type, but text had to be stored in numerical variables, which in popular computers could hold four characters. In modern times, there is no reason for this limitation, but ecologists are used to these names, and they may be practical to avoid congestion in ordination plots.  
CEP名最初被使用，因为老FORTRAN IV不CHARACTER数据类型，但文字必须存储在变量的数值，这在流行的计算机，可容纳4个字符。在近代，有没有这种限制的原因，但生态学家们用这些名字，他们可能是在协调图的实际，以避免拥塞。


值----------Value----------

Function returns CEP names.
函数返回CEP名。


注意----------Note----------

The function is simpleminded and rigid. You must write a better one if you need.  
该功能是头脑简单的和刚性的。你必须写一个更好的，如果你需要。


（作者）----------Author(s)----------


Jari Oksanen



参见----------See Also----------

make.names, strsplit, substring, paste, abbreviate.
make.names，strsplit，substring，paste，abbreviate。


实例----------Examples----------


make.cepnames(c("Aa maderoi", "Poa sp.", "Cladina rangiferina",
"Cladonia cornuta", "Cladonia cornuta var. groenlandica",
"Cladonia rangiformis", "Bryoerythrophyllum"))
data(BCI)
colnames(BCI) <- make.cepnames(colnames(BCI))

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