oddsratio(vcd)
oddsratio()所属R语言包:vcd
(Log) Odds Ratios
(log)的比值比
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Computes (log) odds ratios and their asymptotic standard errors for (possibly) stratified data.
计算(对数)的比值比和他们的的渐近标准的错误(可能)分层数据。
用法----------Usage----------
oddsratio(x, stratum = NULL, log = TRUE)
## S3 method for class 'oddsratio'
plot(x, conf_level = 0.95, type = "o",
xlab = NULL, ylab = NULL, xlim = NULL, ylim = NULL, whiskers = 0.1,
baseline = TRUE, transpose = FALSE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
a 2 by 2 by ... table.
2×2 ...表。
参数:stratum
vector of strata dimensions.
向量的阶层尺寸。
参数:log
if FALSE, ordinary odds ratios are computed.
如果FALSE,普通的比值比计算。
参数:conf_level
if not NULL or FALSE, conf_level-% confidence intervals are plotted for each data point.
如果不是NULL或FALSE,conf_level - %置信区间绘制的每个数据点。
参数:type
plot type.
图类型。
参数:xlab
label for the x-axis. Defaults to "Strata" if transpose is FALSE.
标签的x轴。默认为"Strata"如果transpose是FALSE。
参数:ylab
label for the y-axis. Defaults to "Strata" if transpose is TRUE.
标签的y轴。默认为"Strata"如果transpose是TRUE。
参数:xlim
x-axis limits. Ignored if transpose is FALSE.
x轴的限制。忽略如果transpose是FALSE。
参数:ylim
y-axis limits. Ignored if transpose is TRUE.
y轴的限制。忽略如果transpose是TRUE。
参数:baseline
if TRUE, a red dashed line is plotted at a value of 1 (in case of odds) or 0 (in case of log-odds).
如果TRUE,一个红色的虚线绘制在一个值为1(在赔率的情况下)或0(的log赔率的情况下)。
参数:transpose
if TRUE, the plot is transposed.
如果TRUE,该图调换。
参数:whiskers
width of the confidence interval whiskers.
宽的置信区间的胡须。
参数:...
other graphics parameters (see par).
其他的图形参数(见par“)。
值----------Value----------
An object of class "logoddsratio", which is simply a vector of (log) odds ratios with dimensionality depending on stratum, along with the following attributes:
类的一个对象"logoddsratio",这是一个简单的向量的比值比(log)维取决于stratum,以及具有以下属性:
参数:ASE
a numeric vector with the asymptotic standard errors.
一个数值向量的渐近标准误差。
参数:log
logical indicating whether log odds ratios or common odds ratios are computed.
逻辑,是否log的比值比或共同的几率比计算。
注意----------Note----------
In case of zero entries, 0.5 will be added to the table.
以非零项的情况下,0.5将被添加到表中。
The summary method prints the standard errors and—for log odds ratios—also computes and prints asymptotic z tests (standardized log odds ratios) and the corresponding p values.
summary方法打印和log的比值比也计算和打印渐近z测试(标准的对数比值比)和相应的p值的标准误差。
There is a confint method for computing confidence intervals for the (log) odds ratios.
有一个confint方法计算的置信区间为(log)的比值比。
The plot method plots (log) odds ratios, computed by oddsratio for 2 x 2 x k tables, along with confidence intervals.
plot方法图(对数)的比值比,计算的oddsratio2 x 2 x k表,随着置信区间。
(作者)----------Author(s)----------
David Meyer <a href="mailtoavid.Meyer@R-project.org">David.Meyer@R-project.org</a>
参考文献----------References----------
Visualizing Categorical Data. SAS Institute, Cary, NC.
参见----------See Also----------
confint
confint
实例----------Examples----------
## load Coal Miners data[#矿工数据加载]
data("CoalMiners")
## compute log odds ratios[计算log的比值比]
lor <- oddsratio(CoalMiners)
lor
## summary with z tests[#与z测试总结]
summary(lor)
## confidence intervals[#置信区间]
confint(lor)
## visualization[#可视化]
plot(lor,
xlab = "Age Group",
main = "Breathelessness and Wheeze in Coal Miners")
## add quadratic model[#添加二次模型]
g <- seq(25, 60, by = 5)
m <- lm(lor ~ g + I(g^2))
lines(fitted(m), col = "red")
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