readMIDAS(CellNOptR)
readMIDAS()所属R语言包:CellNOptR
Reads in a csv MIDAS file
读取一个csv MIDAS的文件
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function takes in a single argument, the name of a csv MIDAS file containing the data, and returns a list that contains all the elements to build a CNOlist. The output of this function should be used as input for makeCNOlist.
这个函数接受一个参数,一个CSV MIDAS的数据文件的名称,并返回一个列表,包含了所有的元素,以建立一个CNOlist。应使用此函数的输出作为输入makeCNOlist。
用法----------Usage----------
readMIDAS(MIDASfile)
参数----------Arguments----------
参数:MIDASfile
a csv MIDAS file
CSV MIDAS的文件
Details
详情----------Details----------
This function does not return a CNOlist, but the output of this function can be used directly into makeCNOlist to create one. The MIDAS file format is described in Saez-Rodriguez et al. (2008).
这个函数不返回一个CNOlist,但这个函数的输出可以用来,直接makeCNOlist创建一个。 MIDAS文件格式描述在赛斯罗德里格斯等人。 (2008年)。
If you have all of the readouts measured at the same series of time points, you can specify a unique DA: column which must have the format "DA:ALL".
如果你有所有在同一系列的时间点测得的读数,您可以指定一个独特的DA:列必须有格式“DA:所有”。
值----------Value----------
this function returns a list with fields:
这个函数返回一个字段列表:
参数:dataMatrix
matrix containing the data in the MIDAS file
矩阵在MIDAS文件包含的数据
参数:TRcol
indexes of the columns that contain the treatments (excluding cell line)
索引的列包含处理(不包括单元株)
参数:DAcol
indexes of the columns that contain the data time points
索引中的列包含数据的时间点
参数:DVcol
indexes of the columns that contain the actual values (measurements)
索引中的列包含实际值(测量)
作者(S)----------Author(s)----------
C.Terfve
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
makeCNOlist
makeCNOlist
举例----------Examples----------
tmpdir<-tempdir()
setwd(tmpdir)
cpfile<-dir(system.file("ToyModel",package="CellNOptR"),full=TRUE)
file.copy(from=cpfile,to=getwd(),overwrite=TRUE)
dataToy<-readMIDAS(MIDASfile='ToyDataMMB.csv')
CNOlistToy<-makeCNOlist(dataset=dataToy,subfield=FALSE)
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