R语言 VarEff包 NTdist()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

NTdist(VarEff)
NTdist()所属R语言包：VarEff

                                         Graphical summary
                                         图形摘要

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Graphical summary of the posterior distribution of estimates of Log(Ne) in the past (a 2D plot).
在过去的后验分布估计的log（NE）（2D绘图）的图形摘要。


用法----------Usage----------


NTdist(NameBATCH = NULL, MUTAT = NULL, TMAX = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：NameBATCH
[matrix]: File .Batch create by the function VarEff.  
[矩阵]：文件批量创建的功能VarEff。


参数：MUTAT
[numeric]:Mutation rate.  
[数字]：突变率。


参数：TMAX
[integer]ength of the period for which the distributions of Log(Ne) in the past are generated.  
[整数]：长度的分布产生log（NE）在过去的时期。


Details

详细信息----------Details----------

The function NTdist() uses the job.Batch file and makes a figure to summarise the posterior distribution of  Log(Ne) in a certain period (TMAX) given by the user.
功能NTdist（）使用job.Batch的文件，并在一定期限内（TMAX）的用户提供一个数字来总结log（NE）的后验分布。

The given mutation rate is used to choose natural scales (census size and generations),  or reduced scales (theta and generations times mutation rate) if the mutation rate is set to 0. <br>
使用给定的突变速率，选择天然鳞片（普查的大小和代），或缩小比例（theta和几代人的时间的突变率），如果突变速率设置为0。参考

The graph is plotted and saved in a text file job.2D of 101 lines: <br>
图的绘制并保存在参考101线一个文本文件job.2D的：

Line 1, column 1: rate of coverage of the plotted distributions.
第1行，第1列：覆盖面绘制的分布率。

Line 1, columns 2 to 101: abscissa (times from 0 to TMAX when the Log(Ne) distribution is estimated).<br>
1号线，2 101列：横坐标（时间从0到TMAX时的log（℃）分布估计）。<BR>

Lines 2 to 101, column 1: ordinates (values of Log(Ne) in the selected range).
第2行至第101，第1列：坐标（log（NE）在选定的范围内）。

Lines 2 to 101, columns 2 to 101: densities of Log(Ne) (integer values).
第2行至第101，列2至101：登陆（Ne）的密度（整数值）。


值----------Value----------


参数：R plot
In R console: Graphical summary of the posterior distribution of estimates of Log(Ne) in the past.
在R控制台log（NE）的估计，在过去的后验分布的图形摘要。


参数：job.2D
Text file, 101 lines and 101 columns.
文本文件，101行和101列。


注意----------Note----------

More details on the model can be found on the website: https://qgp.jouy.inra.fr
更多细节的模型，可以在网站上找到：https://qgp.jouy.inra.fr


（作者）----------Author(s)----------



Natacha Nikolic &lt;documents_57@hotmail.com&gt; and Claude Chevalet &lt;claude.chevalet@toulouse.inra.fr&gt;




参考文献----------References----------




参见----------See Also----------

Overview: VarEff-package <br> Exemple: InputTest <br> HelpData: HelpData
概述：VarEff-package的<BR>为例：“InputTest的<BR> HelpData：HelpData


实例----------Examples----------


NTdist (NameBATCH = system.file("extdata/job.Batch", package = "VarEff")
, MUTAT = 0.01, TMAX = 200)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。