R语言 CellNOptR包 findNONC()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

findNONC(CellNOptR)
findNONC()所属R语言包：CellNOptR

                                         Find the indexes of the non-observable and non controllable species
                                         非观察和非可控物种指标

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function finds the indexes of the non-observable and non controllable species and returns the indices, in the model, of the species to remove
发现此功能的非观察和非可控物种索引和返回的指标，在模型的品种，以消除


用法----------Usage----------


findNONC(Model, indexes, verbose)



参数----------Arguments----------

参数：Model
a model, as created by readSif  
模型，作为由readSif创建


参数：indexes
a list of indices of species measured, stimulated or inhibited, as created by indexFinder  
指数衡量物种名单，刺激或抑制，由indexFinder创建


参数：verbose
do you want information about the ncno species printed on the screen? Default to FALSE but we would advise to put it to true the first time that the function is called  
你想在屏幕上打印的ncno物种的信息？默认为false，但我们会建议把它真正功能，被称为第一次


Details

详情----------Details----------

This function uses the function floyd.warshall.all.pairs.sp from the package RBGL.  Non observable nodes are those that do not have a path to any measured species in the model, whereas non controllable nodes are those that do not receive any information from a species that is perturbed in the data.
这个函数使用从包RBGL的功能floyd.warshall.all.pairs.sp。非观察节点是那些不具备测量模型中的任何物种的路径，但不可控节点是那些没有收到任何信息，从一个物种，在数据扰动。


值----------Value----------

a vector of indices of species to remove
一个物种指数矢量删除


作者（S）----------Author(s)----------



C. Terfve




参见----------See Also----------

cutNONC, indexFinder, readSif
cutNONC，indexFinder，readSif


举例----------Examples----------


data(CNOlistToy,package="CellNOptR")
data(ToyModel,package="CellNOptR")
checkSignals(CNOlistToy,ToyModel)
indicesToy<-indexFinder(CNOlistToy,ToyModel,verbose=FALSE)
ToyNCNOindices<-findNONC(ToyModel,indicesToy,verbose=FALSE)

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