R语言 CellNOptR包 expandGates()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

expandGates(CellNOptR)
expandGates()所属R语言包：CellNOptR

                                         Expand the gates of a model
                                         展开模型的大门

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes in a model and splits all AND gates into ORs.  In addition, wherever there are more than one and up to 5 reactions coming into one node, it creates all possible ANDs combinations of them, but considering only ANDs with 2 and 3 inputs
此功能需要在一个模型，并与门分割成胜算。此外，只要有一个以上的高达5反应到一个节点，它会创建所有这些可能与门的组合，但考虑到只有2和3输入与门


用法----------Usage----------


expandGates(Model)



参数----------Arguments----------

参数：Model
a model structure  
模型结构


Details

详情----------Details----------

This function returns a model with additional fields that help keep track of the processing done on the network.  I would advice not to overwrite on the initial model but rather to assign the result of this function to a variable with a different name.
此函数返回一个模型，帮助跟踪在网络上做了处理的其他领域。我会建议不要覆盖在初始模型，而是一个具有不同名称的变量分配这个函数的结果。


值----------Value----------

returns a Model, with additional fields:
返回一个模型，额外的字段：


参数：SplitANDs
list that contains a named element for each AND reac that has been split, and each element contains a vector with the names of the of the reactions that result from the split if nothing was split, this element has the default value $initialReac  [1] "split1" "split2"
列表，其中包含命名为每个反应已经分裂的元素，每个元素包含一个矢量的名字的反应，如果没有被分裂，分裂的结果，该元素的默认值$ initialReac [1] “split1”，“split2”


参数：newANDs
list that contains an element for each new '&' gate, named by the name of this new and reac, and containing a vector of the names of the reactions from which it was created (contains all the reacs in that pool, not the particular ones, this could be improved)
列表中包含的每一个新的和门的名字命名这个新的和反应，并含有一个名称从创建它的反应向量（元素包含在该池中所有reacs，而不是特别的，这可以改善）


注意----------Note----------

This function could be simplified in the future.
在未来，这个功能可以简化。


作者（S）----------Author(s)----------



C.Terfve




举例----------Examples----------


#load data[数据加载]

data(CNOlistToy,package="CellNOptR")
data(ToyModel,package="CellNOptR")

#pre-process the model[预过程模型]

indicesToy<-indexFinder(CNOlistToy,ToyModel,verbose=TRUE)
ToyNCNOindices<-findNONC(ToyModel,indicesToy,verbose=TRUE)
ToyNCNOcut<-cutNONC(ToyModel,ToyNCNOindices)
indicesToyNCNOcut<-indexFinder(CNOlistToy,ToyNCNOcut)
ToyNCNOcutComp<-compressModel(ToyNCNOcut,indicesToyNCNOcut)
indicesToyNCNOcutComp<-indexFinder(CNOlistToy,ToyNCNOcutComp)
ToyNCNOcutCompExp<-expandGates(ToyNCNOcutComp)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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