untb(untb)
untb()所属R语言包：untb
Ecological drift simulation under the Unified Neutral
生态漂流模拟下的统一中性
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Simulates ecological drift under the UNTB. Function untb() carries out the simulation; function select() carries out a single generational step.
模拟生态漂流下UNTB。函数untb()进行了模拟函数select()进行单代第一步。
用法----------Usage----------
untb(start, prob=0, D=1, gens=150, keep=FALSE, meta=NULL)
select(a, D=length(a), prob=0, meta=NULL)
select.mutate(a, D=length(a), prob.of.mutate=0)
select.immigrate(a, D=length(a), prob.of.immigrate=0, meta)
参数----------Arguments----------
参数：a, start
Starting ecosystem; coerced to class census. Usually, pass an object of class count; see examples. To start with a monoculture of size 10, use start=rep(1,10) and to use start=1:10.
启动生态系统;强制转换为类人口普查。通常情况下，通过对象的类别数;看到的例子。要开始与单养大小为10，使用start=rep(1,10)和使用start=1:10。
参数：prob, prob.of.immigrate, prob.of.mutate
Probability of “new” organism not being a descendent of an existing individual
“新”生物体的概率不现有的个体的后代
参数：D
Number of organisms that die in each timestep
在每一个时间步生物体死亡数
参数：gens
Number of generations to simulate
数代模拟
参数：keep
In function untb() Boolean with default FALSE meaning to return the system at the end of the simulation and TRUE meaning to return a matrix whose rows are the ecosystem at successive times
在功能untb()布尔默认FALSE这意味着结束时，将系统返回的模拟和TRUE的这意味着返回一个矩阵的行是生态系统在连续的时间
参数：meta
In function untb(), the metacommunity; coerced to a count object. Default of NULL means to use a “greedy” system in which every mutation gives rise to a new, previously unencountered species. This would correspond to an infinitely large, infinitely diverse, Hubbellian ecosystem (which is not too ridiculous an assumption for a small island near a large diverse mainland). In function select.immigrate(), a simplified representation of a metacommunity.
在功能untb()，集合群落，强制转换为一个count对象。默认的NULL是指使用“贪婪”的系统中，每一个突变产生一个新的，以前unencountered的物种。这相当于一个无限大的，无限多样的，Hubbellian的生态系统（这是不是太可笑了一个小岛附近的一个大型的不同大陆的假设）。在功能select.immigrate()，简化表示的集合群落。
Details
详细信息----------Details----------
Functions select.immigrate() and select.mutate() are not really intended for the end user; they use computationally efficient (and opaque) integer arithmetic.
功能select.immigrate()和select.mutate()是不是真的打算为最终用户，他们使用的计算效率和不透明的整数运算。
（作者）----------Author(s)----------
Robin K. S. Hankin
参考文献----------References----------
Princeton University Press.
实例----------Examples----------
data(butterflies)
untb(start=butterflies, prob=0, gens=100)
a <- untb(start=1:10,prob=0.005, gens=1000,keep=TRUE)
plot(species.count(a),type="b")
matplot(species.table(a),type="l",lty=1)
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发表于 2012-10-1 13:32:59
