R语言 untb包 simpson()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

simpson(untb)
simpson()所属R语言包：untb

                                        Simpson's diversity index
                                         辛普森多样性指数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Simpson's diversity index
辛普森多样性指数


用法----------Usage----------


simpson(x, with.replacement=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：x
Ecosystem vector; coerced to class count
生态系统的向量;强制转换类count，


参数：with.replacement
Boolean, with default FALSE meaning to sample without replacement; see details section
布尔值，默认FALSE的这意味着品尝无需更换，详情请参阅“部分


Details

详细信息----------Details----------

Returns the Simpson index D: the probability that two randomly sampled individuals belong to different species.
返回Simpson指数D：概率随机抽样，两个人属于不同的物种。

There is some confusion as to the precise definition: some authors specify that the two individuals are necessarily distinct (ie sampling without replacement), and some do not.
有一些混乱的精确定义：一些指定的两个人必然是不同的（即采样无需更换），和一些不。

Simpson (1949) assumed sampling without replacement and gave
辛普森（1949）假设采样无需更换，并给

in our notation.
在我们的符号。

He and Hu (2005) assumed sampling with replacement:
他和胡锦涛（2005年）假定采样与更换：

The difference is largely academic but is most pronounced when many species occur with low counts (ie close to 1).
所不同的主要是学术，但发生许多物种时，与低计数（即接近1）是最明显的。


（作者）----------Author(s)----------


Robin K. S. Hankin



参考文献----------References----------

“The Unified Neutral Theory of Biodiversity”. Princeton University Press.
&ldquo;Hubbell's Fundamental Biodiversity Parameter and the Simpson Diversity Index&rdquo;.  Ecology Letters, volume 8, pp386-390. doi: <code>10.1111/j.1461-0248.2005.00729.x</code>
Nature, volume 163, p688

参见----------See Also----------

preston
preston


实例----------Examples----------


data(butterflies)

D <- simpson(butterflies)
theta <- optimal.prob(butterflies)*2*no.of.ind(butterflies)

# compare theta with D/(1-D) (should be roughly equal; see He &amp; Hu 2005):[比较THETA D /（1-D）（应大致相等，见他与胡锦涛2005）：]
theta
D/(1-D)


# Second argument pedantic in practice.[在实践中的第二个参数迂腐。]

# Mostly, the difference is small:[大多数情况下，不同的是小的：]
simpson(butterflies,FALSE) - simpson(butterflies,TRUE)

# Most extreme example:[最极端的例子：]
x <- count(c(1,1))
simpson(x,TRUE)
simpson(x,FALSE)



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