optimal.prob(untb)
optimal.prob()所属R语言包:untb
Returns an estimate of the fundamental biodiversity number
返回的基本的生物多样性编号的估计
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Returns a maximum likelihood estimate for the fundamental biodiversity number theta (function optimal.theta()) or the probability of mutation (function optimal.prob()) and optionally return information about the likely error
返回一个最大似然估计的基本生物多样性数量theta(函数optimal.theta())或突变的概率(功能optimal.prob()),并选择返回的信息可能错误
用法----------Usage----------
optimal.prob(x, interval=NULL, N=NULL, like=NULL, ...)
optimal.theta(x, interval=NULL, N=NULL, like=NULL, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
Ecosystem vector or species count table
生态系统的向量或物种的伯爵表
参数:interval
Bracketing interval for probability of mutation to be passed to the optimization routine (here optimize()). Default of NULL means to use a wide interval. Note that this argument is interpreted as an interval of theta for both optimal.prob() and optimal.theta().
突变概率包围时间间隔为要传递到的优化例程(此处optimize())。默认的NULL是指使用宽间隔。请注意,这种说法被解释为间隔theta都optimal.prob()和optimal.theta()。
参数:N
Integer; the number of parametric resampled estimates to give. Default of NULL means to return just the maximum likelihood estimate
整数数的参数重新取样估计给。默认的NULL是指只返回最大似然估计
参数:like
Units of likelihood to calculate credible interval. Edwards recommends using 2
单位计算可信区间的可能性。爱德华兹建议使用2
参数:...
Further arguments passed to optimize()
更多参数传递给optimize()
注意----------Note----------
The fundamental biodiversity parameter theta is 2*nu*J, where nu is the probability of mutation (ie, as estimated by optimal.prob()), and J is the size of the ecosystem.
生物多样性的基本参数theta是2*nu*J,nu是突变的概率(即,估计optimal.prob()),和J的大小生态系统。
For the general case of dispersal limitation, see functions etienne() and optimal.params().
对于一般情况下的扩散限制,请参阅功能etienne()和optimal.params()。
(作者)----------Author(s)----------
Robin K. S. Hankin
参见----------See Also----------
etienne,optimal.params.sloss,optimal.params.gst
etienne,optimal.params.sloss,optimal.params.gst
实例----------Examples----------
data(butterflies)
optimal.prob(butterflies)
optimal.theta(butterflies)
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