unmarkedFramePCount(unmarked)
unmarkedFramePCount()所属R语言包:unmarked
Organize data for the N-mixture model fit by pcount
组织数据的N-混合模型的拟合pcount的
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Organizes repeated count data along with the covariates.
组织重复测量数据的协变量。
用法----------Usage----------
unmarkedFramePCount(y, siteCovs=NULL, obsCovs=NULL, mapInfo)
参数----------Arguments----------
参数:y
An RxJ matrix of the repeated count data, where R is the number of sites, J is the maximum number of sampling periods per site.
一种RXJ矩阵的重复计数数据,其中R是的站点数,J是采样周期每个站点的最大数目。
参数:siteCovs
A data.frame of covariates that vary at the site level. This should have M rows and one column per covariate
Adata.frame在站点级别的不同的协变量。这应该具有M行和一列,每协变量
参数:obsCovs
Either a named list of data.frames of covariates that vary within sites, or a data.frame with RxJ rows in site-major order.
data.frame的一个命名列表网站内变化的协变量,或一个data.frame网站主要为了RXJ行。
参数:mapInfo
Currently ignored </table>
目前忽略</ TABLE>
Details
详细信息----------Details----------
unmarkedFramePCount is the S4 class that holds data to be passed
值----------Value----------
an object of class unmarkedFramePCount
一个类unmarkedFramePCount的对象
参见----------See Also----------
unmarkedFrame-class, unmarkedFrame,
unmarkedFrame-class,unmarkedFrame,
实例----------Examples----------
# Fake data[假数据]
R <- 4 # number of sites[一些网站]
J <- 3 # number of visits[访问次数]
y <- matrix(c(
1,2,0,
0,0,0,
1,1,1,
2,2,1), nrow=R, ncol=J, byrow=TRUE)
y
site.covs <- data.frame(x1=1:4, x2=factor(c('A','B','A','B')))
site.covs
obs.covs <- list(
x3 = matrix(c(
-1,0,1,
-2,0,0,
-3,1,0,
0,0,0), nrow=R, ncol=J, byrow=TRUE),
x4 = matrix(c(
'a','b','c',
'd','b','a',
'a','a','c',
'a','b','a'), nrow=R, ncol=J, byrow=TRUE))
obs.covs
umf <- unmarkedFramePCount(y=y, siteCovs=site.covs,
obsCovs=obs.covs) # organize data[组织数据]
umf # take a l[一l]
summary(umf) # summarize data[汇总数据]
fm <- pcount(~1 ~1, umf, K=10) # fit a model[拟合模型]
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注:
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