R语言 unmarked包 unmarkedFramePCO()函数中文帮助文档(中英文对照)

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unmarkedFramePCO(unmarked)
unmarkedFramePCO()所属R语言包：unmarked

                                        Create an object of class unmarkedFramePCO that contains data used by pcountOpen.
                                         创建对象的的类unmarkedFramePCO包含数据使用pcountOpen。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Organizes repeated count data along with the covariates and possibly the dates on which each survey was conducted. This S4 class is required by the data argument of pcountOpen
随着协变量和可能的日期进行调查，每个组织重复测量数据。 S4类需要的数据参数pcountOpen


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：y
An MxJT matrix of the repeated count data, where M is the number of sites, J is the maximum number of secondary sampling periods per site and T is the maximum number of primary sampling periods per site.
一种MxJT矩阵的重复计数数据，其中M是站点数，J是每个站点的二次采样周期的最大数目，T是每个站点的主采样周期的最大数目。


参数：siteCovs
A data.frame of covariates that vary at the site level. This should have M rows and one column per covariate
Adata.frame在站点级别的不同的协变量。这应该具有M行和一列，每协变量


参数：obsCovs
Either a named list of data.frames of covariates that vary within sites, or a data.frame with MxJT rows in site-major order.
data.frame的一个命名列表网站内变化的协变量，或一个data.frame网站主要为了MxJT行。


参数：yearlySiteCovs
Either a named list of MxT data.frames, or a site-major data.frame with MT rows and 1 column per covariate.
MXT data.frame的一个命名列表，或一个网站主要data.frame MT行1列的每个协变量。


参数：mapInfo
Currently ignored
目前被忽略


参数：numPrimary
Maximum number of observed primary periods for each site
观察到的主周期的最大数目为每个站点


参数：primaryPeriod
matrix of integers indicating the primary period of each survey.
矩阵的整数，表示每个调查的初级阶段。


Details

详细信息----------Details----------

unmarkedFramePCO is the S4 class that holds data to be passed to the pcountOpen model-fitting function.
unmarkedFramePCO是S4级保存数据将被传递给pcountOpen模型的拟合函数。

The unmarkedFramePCO class is similar to the unmarkedFramePCount class except that it contains the dates for each survey, which needs to be supplied .
unmarkedFramePCO类是类似于类的unmarkedFramePCount不同之处在于它包含了每个调查的日期，需要提供。


值----------Value----------

an object of class unmarkedFramePCO
一个类unmarkedFramePCO的对象


参见----------See Also----------

unmarkedFrame-class, unmarkedFrame,
unmarkedFrame-class，unmarkedFrame，


实例----------Examples----------



# Repeated count data with 5 primary periods and[重复测量数据与5个主要时期，]
# no secondary sampling periods (ie J==1)[无二次采样周期（即Ĵ== 1）]
y1 <- matrix(c(
    0, 2, 3, 2, 0,
    2, 2, 3, 1, 1,
    1, 1, 0, 0, 3,
    0, 0, 0, 0, 0), nrow=4, ncol=5, byrow=TRUE)

# Site-specific covariates[站点特定的协变量]
sc1 <- data.frame(x1 = 1:4, x2 = c('A','A','B','B'))

# Observation-specific covariates[观察具体的协变量]
oc1 <- list(
    x3 = matrix(1:5, nrow=4, ncol=5, byrow=TRUE),
    x4 = matrix(letters[1:5], nrow=4, ncol=5, byrow=TRUE))

# Primary periods of surveys[主要调查期间]
primaryPeriod1 <- matrix(as.integer(c(
    1, 2, 5, 7, 8,
    1, 2, 3, 4, 5,
    1, 2, 4, 5, 6,
    1, 3, 5, 6, 7)), nrow=4, ncol=5, byrow=TRUE)


# Create the unmarkedFrame[创建unmarkedFrame]
umf1 <- unmarkedFramePCO(y=y1, siteCovs=sc1, obsCovs=oc1, numPrimary=5,
    primaryPeriod=primaryPeriod1)

# Take a look[一起来看看]
umf1
summary(umf1)






# Repeated count data with 4 primary periods and[重复测量数据与4个主要时期，]
# no 2 secondary sampling periods (ie J=2)[不为2的采样周期（即J = 2）]
y2 <- matrix(c(
    0,0,  2,2,  3,2,  2,2,
    2,2,  2,1,  3,2,  1,1,
    1,0,  1,1,  0,0,  0,0,
    0,0,  0,0,  0,0,  0,0), nrow=4, ncol=8, byrow=TRUE)


# Site-specific covariates[站点特定的协变量]
sc2 <- data.frame(x1 = 1:4, x2 = c('A','A','B','B'))

# Observation-specific covariates[观察具体的协变量]
oc2 <- list(
    x3 = matrix(1:8, nrow=4, ncol=8, byrow=TRUE),
    x4 = matrix(letters[1:8], nrow=4, ncol=8, byrow=TRUE))

# Yearly-site covariates[每年现场的协变量]
ysc <- list(
    x5 = matrix(c(
        1,2,3,4,
        1,2,3,4,
        1,2,3,4,
        1,2,3,4), nrow=4, ncol=4, byrow=TRUE))

# Primary periods of surveys[主要调查期间]
primaryPeriod2 <- matrix(as.integer(c(
    1,2,5,7,
    1,2,3,4,
    1,2,4,5,
    1,3,5,6)), nrow=4, ncol=4, byrow=TRUE)

# Create the unmarkedFrame[创建unmarkedFrame]
umf2 <- unmarkedFramePCO(y=y2, siteCovs=sc2, obsCovs=oc2,
    yearlySiteCovs=ysc,
    numPrimary=4, primaryPeriod=primaryPeriod2)

# Take a look[一起来看看]
umf2
summary(umf2)



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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。