tspc.plotcv(TSPC)
tspc.plotcv()所属R语言包:TSPC
Plot output from tspc.cv
图从tspc.cv输出
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plots pre-validation results from plotcv, to aid in choosing best threshold
图预验证的结果从plotcv,以帮助选择最佳阈值
用法----------Usage----------
tspc.plotcv(object, call.win.metafile=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:object
Object returned by tspc.cv
返回的对象tspc.cv
参数:call.win.metafile
call.win.metafile Ignore, for use by Excel program
call.win.metafile忽略,使用Excel程序
(作者)----------Author(s)----------
Yuping Zhang
实例----------Examples----------
x = list()
for(i in 1:2){
set.seed(i+123)
x[[i]] = matrix(rnorm(500*100), ncol=100)
}
y = sample(c(5:100), size=100, replace=TRUE)
censoring = sample(c(0,1), size=100, replace=TRUE)
data = list(x = x, y=y, censoring.status=censoring, genenames = as.character(paste("gene", c(1:500), sep="")), geneid = as.character(paste("gene", c(1:500), sep="")))
x = list()
for(i in 1:2){
set.seed(i+133)
x[[i]] = matrix(rnorm(500*100), ncol=100)
}
y = sample(c(5:100), size=100, replace=TRUE)
censoring = sample(c(0,1), size=100, replace=TRUE)
data.test = list(x = x, y=y, censoring.status=censoring, genenames = as.character(paste("gene", c(1:500), sep="")), geneid = as.character(paste("gene", c(1:500), sep="")))
fit = tspc.train(data, data.test, type="survival")
cv.obj = tspc.cv(fit$fit.obj, data, type="survival", n.fold=2)
tspc.plotcv(cv.obj)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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