print.trioFS(trio)
print.trioFS()所属R语言包:trio
Printing and plotting of a trioFS object
打印和绘图的trioFS对象的
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Prints or plots the most important interactions found in a trioFS analysis.
打印或绘制最重要的相互作用发现在一个trioFS的分析。
用法----------Usage----------
## S3 method for class 'trioFS'
print(x, topX = 5, show.prop = TRUE, coded = FALSE, digits = 2, ...)
## S3 method for class 'trioFS'
plot(x, topX = 15, show.prop = FALSE, coded = TRUE, cex = 0.9,
pch = 16, col = 1, force.topX = FALSE, include0 = TRUE, add.v0 = TRUE,
v0.col = "grey50", main = NULL, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
an object of class trioFS, i.e. the output of trioFS.
类的一个对象trioFS,即输出的trioFS。
参数:topX
integer specifying how many interactions should be shown. If topX is larger than the number of interactions contained in x, all the interactions are shown. Additionally to the topX most important interactions, any interaction having the same importance as the topX most important one are printed or (if force.topX = FALSE) plotted.
整数,指定多少相互作用应该显示出来。如果topX是大于包含在x,示出所有的相互作用的数目的相互作用。此外topX最重要的作用,任何的互动具有相同的重要性作为topX最重要的一个是printed或(如果force.topX = FALSE)plot特德。
参数:show.prop
should the proportions of models containing the respective interactions be added to the output (if print is used)? If the output of trioFS should be plotted, then the proportions of models can be plotted instead of the values of the importance measure by setting show.prop = TRUE.
的比例应的模型包含被添加到输出各自的相互作用(如果print被使用)?如果输出trioFS应该是plot特德,然后模型的比例可以被绘制的重要性措施的值,而不是通过设定show.prop = TRUE。
参数:coded
should the coded variable names be displayed? Might be useful if the actual variable names are pretty long. The coded variable name of the j-th variable is Xj.
编码的变量名应该显示?可能是有用的实际变量名是相当长的。的第j个变量的变量名编码是Xj。
参数:digits
number of digits shown in the printed output.
显示在print编输出的数字数。
参数:cex
a numeric value specifying the relative size of the text and symbols.
指定一个数值的相对大小的文字和符号。
参数:pch
specifies the used symbol. See the help of par for details.
指定所使用的符号。有关详细信息,请参阅帮助par。
参数:col
the color of the text and the symbols. See the help of par for how colors can be specified.
的文字和符号的颜色。查看帮助par颜色可以指定。
参数:force.topX
if TRUE exactly topX interactions are plotted. If FALSE (default) all interactions up to the topXth most important one and all interactions having the same importance as the topXth most important one are plotted.
如果TRUE准确topX的相互作用是plot特德。如果FALSE(默认值)的所有交互topX个最重要的,所有的相互作用具有相同的重要性topX个最重要的一个是plot特德。
参数:include0
should the x-axis include zero regardless whether the importances of the shown interactions are much higher than 0?
x轴应该包括零无论所示的相互作用的重要性是否是远高于0?
参数:add.v0
should a vertical line be drawn at x = 0? Ignored if include0 = FALSE and all importances are larger than zero.
一条垂直线被画在x = 0?如果忽略include0 = FALSE和所有的重要性大于零。
参数:v0.col
the color of the vertical line at x = 0. See the help page of par for how colors can be specified.
的颜色x = 0的垂直线。请参阅帮助页面par可以指定颜色。
参数:main
character string naming the title of the plot. If NULL, a standard title is added to the plot.
字符串命名的标题的图。如果NULL,一个标准的标题中添加的图。
参数:...
Ignored.
忽略。
(作者)----------Author(s)----------
Holger Schwender, <a href="mailto:holger.schwender@udo.edu">holger.schwender@udo.edu</a>
参见----------See Also----------
trioFS
trioFS
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